كلمه هاي كليدي:بيوشيمي ،كنترل بيولوژيكي،مولكولي،رايزوباكتريها
رايزوسفرناحيه اي ازخاك اطراف ريشه قراردارندكه تحت تاثيرآن است.شناخت اكولوژيكي ميكروارگانيسمها اساس لازم براي آغازتلقيح ميكروبها به داخل محيط هاي باز است.كه اين ميكروبها ممكن باآفتكش هاي شيميايي سازگارباشد.عامل هاي بيولوژيكي مانندباكتريهاي PGPR(باكتري افزايش رشدگياهان)در بعضي موارد به عنوان كنترل بيولوژيكي به كار مي روند.باكتريها اغلب درخلل وفرج خاك ويادرسطح خاك قراردارند.باكتريهاي گسترش رشدگياهان روي ريشه هاياداخل آن يادررايزوسفرهابراي رشدقرارگرفتند.رايزوباكتريها داخل نقاط آلوده روي ريشه وكانال هايي كه بوسيله رايزوسفرها ايجاد شده به خوبي رشد مي كنند.پراكندگي ،تكثير وبقا PGPRبه طورجدي تحت تاثير آنتي بيوتيك وبيوتيك ها قرار دارد.
كلوني ريشه
كلوني ريشه در خاكهاي استريل شده بيشتراز خاكهاي استريل نشده است زيراتركيبات آنتي بيوتيك ،شكارگرها وميكرو فلوربومي كمتراست.پاتوژنهايي كه نشانه اي از PGPRهستندمي توانند به طورمنفي يامثبت بر روي PGPRاثركنند.
مهمترين ويژگي باكتريهااختلاف ميان چسبندگيPGPRبه ريشه است ممكن ويژگي نباشد بلكه درنتيجه نيروي الكترواستيك باشد ياممكن ويژگي آن تشخيص بين سطح گليكوپروتيئن كه جزئي از agglutininاست باشد.يك روش براي افزايش كلوني ريشه بوسيله PGPRافزايش سوسپانسيون باكتري به دانه آن گياه ، روش دوم افزايش سوسپانسيون باكتري به خاك،روش سوم آغشته كردن بذرجوانه زده به سوسپانسيون باكتري است.
نقش ژنها ونشانگر DNAدرشناسايي باكتريها دررايزوسفر
Tranoposonsهايي (تواليهايي )كه رمز شده براي مقاومت آنتي بيوتيك ها به طور مكرر براي تنظيم ارگانيسم ها در خاك ورايزوسفر ها استفاده شده اند.باكتريها در رايزوسفرها بوسيله استفاده از نشانگرها ي خاص DNAيا سكوانس RNA كشف شده اند.توسعه سكوانس DNАهدف به وسيله استفاده از زنجيره پليمرازها PCRانجام شد.توسعه به وسيله PCRداراي اثرات مضر اي چون كاهش متابوليك اضافه شدن ماده ژنتيكي ،اصلاح ژنهاي خارجي مي باشد.