درخت اوجا Ulmus minor

باکتری بیماریزا در گوجه فرنگی در خراسان رضوی

اسفندیار ظهور

گوجه فرنگي (Lycopersicon eseulentum Mill) ميزبان تعداد باكتري بيماريزاي گياهي مي باشد پژمردگي باكتريايي گوجه فرنگي ناشي از Ralstonia solanacearum (Rs) درسال1372 از فارس ، بيماري خال زدگي باكتريايي گوجه فرنگي ناشي از Pseudomonas syringae pv tomato (Pss) در سال1373 از ورامين وشانكر باكتريايي گوجه فرنگي Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis(Cmm) در سال 1367 در حومه اروميه ديده شد.علايم بيماري در Pst بصورت لكه هاي گرد و نامنظم تا قهوه اي و سياه با كلروز گسترده و يا محدود روي برگها و لكه هاي بيضوي كشيده روي دمبرگ، كاسبرگ ، دمگل و شاخه وساقه ودر روي ميوه بصورت خالهاي سياه پراكنده سطحي وگاه با هاله كلروتيك روي ميوه رسيده است .در حالي كه در شانكر باكتريايي گوجه فرنگي علائم بيماري شامل پژمردگي بوته بروز شانكر هاي قهو ه اي روي ساقه و دمبرگ ، تيره شدن بافت آوندي و بعضي موارد ظهور لكه هاي مدور سفيد با برجستگي كوچك قهوه اي در مركز آن بر روي پوست ميوه مي باشد. در پژمردگي باكتريايي گوجه فرنگي علايم بيماري عبارت است. از پژمردگي و پلاسيدگي برگها سبز خشكي سريع شاخ و برگ و تغيير رنگ سيستم آوندي ساقه است. علائم پوسيدگي نرم درساقه گياهچه و بوته ها و ميوه هاي گوجه فرنگي در اثر اين دو عاملPectobacterium carotovorum subsp. carotovorum(Pcc) وDickeya chrysanthemi(Dc) ميباشد. طي سالهاي 1385 تا 1387 تعدادي نمونه از بوته هاي آلوده گوجه فرنگي جمع آوري و به روش هاي معمول باكتري شناسي مورد بررسي قرار گرفت نتايج حاصل از اين بررسي به منزله عدم وجود بيماري Cmm در مزارع خراسان رضوي و احتمال وجود پاتواري از Ps بر روي مزارع گوجه فرنگي و وجود باكتري اپي فيت Pantanoe herbicola مي باشد. علائم پوسيدگي نرم در ساقه و گياهچه بوته هاي گوجه فرنگي در اثر عامل Pc نيز مشاهده شد.

Occurrence of Pseudomonas mediterranea on tomato in Brazil

L.M.R. Rodrigues¹, S.A.L. Destéfano², L.O.S. Beriam² and J. Rodrigues-Neto²*

¹ Departamento de Proteção de Plantas, UNESP, 18.603-970, Botucatu, SãoPaulo, Brazil
² Laboratório do Bacteriologia Vegetal, Instituto Biológico, PO Box 70, 13.106-970, Campinas, São Paulo, Brazil

*[e-mail]

Accepted for publication 10 Sep 2009

During the years 2005-2008, symptoms of tomato pith necrosis (TPN) were observed that caused significant losses in several commercial cropsin the State of São Paulo, Brazil. Symptoms were similar to those reported for Pseudomonas corrugata or P. mediteranea and often first appeared near wounds where side-shoots had been removed, causing external dark brown necrosis of stems and degradation of pith (Fig. 1). Isolations from diseased plants on King’s medium B resulted in the growth of a bacterium with smooth or wrinkled colonies producing a greenish-yellow, non-fluorescent, diffusible pigment. Isolates were tested for pathogenicity on young tomato plants by placing a drop of bacterial suspension (10⁸cfu/ ml) in the leaf axils and then pricking the stem with a sterile needle. Control plants were similarly treated using sterile distilled water. Plants were maintained in a glasshouse with temperatures ranging from 25 to 30º C. The type strains of Pseudomonas corrugata (IBSBF 647^T) and P. mediterranea (IBSBF 2059^T) were used for comparative purposes.

The pathogenicity of isolateswas confirmed two weeks after inoculation (Fig. 2). The bacteria were aerobic, positive for oxidase, arginine dihydrolase, nitrate reduction to nitrites, meso-tartrate and histamine utilization, and negative for levan production and aesculin hydrolysis. In rep-PCR using BOX primers, the isolates showed identical profiles to those of the type strain of P. mediterranea (Fig. 3). In PCR using the primers type I ( PC5/1 and PC5/2) for P. corrugata and type II (PC1/1 and PC1/2) for P. mediterranea (Catara et al., 2002) the identities of strains were confirmed by the amplification of a 600 bp DNA fragment specific to P. mediterranea (Fig. 4). Until now, only P. corrugata had been reported as causing TPN in Brazil (Martins et al., 1990; Rodrigues-Neto et al., 1990). Consequently, this is the first report of P. mediterranea causing TPN in Brazil.

 

Figure 1: External symptoms of pith necrosis caused by Pseudomonas mediterranea on tomato stem

 

Figure 2: Pith discoloration in a tomato stem after artificial inoculation with a Brazilian isolate of Pseudomonas mediterranea

 

Figure 3: BOX-PCR fingerprinting patterns of Pseudomonas corrugata and Pseudomonas mediterranea; (M) 100 bp DNA marker, (1) Pseudomonas corrugata type strain (IBSBF 647T) , (2) Pseudomonas mediterranea type strain (IBSBF 2059T), (3-6) Pseudomonas mediterranea isolates from Brazil (IBSBF 1903, IBSBF 2642, IBSBF 2643, IBSBF 2652)

 

Figure 4: PCR amplification of 1100 bp and 600 bp DNA fragment of (1) Pseudomonas corrugata type strain (IBSBF 647T) , (2) Pseudomonas mediterranea type strain (IBSBF 2059T), (3-7) Pseudomonas mediterranea isolates from Brazil (IBSBF 1903, IBSBF 2642, IBSBF 2643, IBSBF 2652, IBSBF 2654), (M) 100 bp DNA marker

---

References

Catara V, Sutra L, Morineau A, Achouak W, Christen R, Gardan L, 2002. Phenotypic and genomic evidence for the revision of Pseudomonas corrugata and proposal of Pseudomonas mediterranea sp. nov. International Journal ofSystematic andEvolutionary Microbiology 52, 1749-1758.

Martins OM, Couto ME, Patella AEC, 1990. Occurrence of Pseudomonas corrugata on tomato in Rio Grande do Sul, Brazil. (Abstract from Congress of the Brazilian Phytopathololgical Society.) Fitopatologia Brasileira 15, 125.

Rodrigues-Neto J, Malavolta Jr VA, Ramos RS, Sinigaglia C, 1990. Ocorrência de Pseudomonas corrugata em tomateiro no Estado de São Paulo. Summa Phytopathologica 16, 279-284.

Acidovorax avenae subsp. citrulli newly reported to cause bacterial fruit blotch of watermelon in Gr

M.C. Holeva*, C.D. Karafla, P.E. Glynos and A.S. Alivizatos

Benaki Phytopathological Institute, 8 S. Delta Str. GR-145 61 Kifissia, Attiki, Greece

*[e-mail]

Accepted for publication 06 Oct 2009

In July 2005 and September 2006, samples of mature fruits of F1 hybrid watermelon (Citrullus lanatus) cv. Obla were received from the areas of Chryssoupoli (Macedonia, northern Greece) and Vagia (central Greece), respectively. Fruits had small, irregular, water-soaked lesions and brown cracks on their surface, brown discolouration and water-soaked areas in the rind underneath the lesions, and watery flesh rot (Figs. 1, 2). Disease incidence was reported as severe in both areas, according to the sample information sheets sent by local agronomists. Bacterial isolates recovered on nutrient agar (NA) from the affected fruits were Gram-negative, oxidase positive, non-fluorescent on King’s medium B, pathogenic to inoculated watermelon fruits and to seedlings of watermelon, melon, cucumber and pumpkin; isolates induced tobacco hypersensitivity and formed characteristic white colonies on nutrient agar. Based on these data, the isolates were identified as Acidovorax avenae subsp. citrulli (Aac).

In May 2008, young grafted watermelon plants (F1 hybrid cv. Byblos) received from the area of Varda (Peloponnese, southern Greece) showed brown, angular, necrotic spots or larger lesions on leaves (Figs. 3, 4). This outbreak was reported by the agronomist in charge of the crop to have affected about 50% of a plot of 12,000 plants. The bacterial isolates recovered on NA from the affected plants showed the above properties and also growth at 41°C, no starch hydrolysis, oxidative glucose metabolism and utilisation of D-galactose, D-glucose, L-arabinose, but not adonitol, arginine or sucrose, as sole carbon source. An immunofluorescence test with Aac-specific polyclonal antiserum (LOEWE, Germany) and sequencing (COGENICS, UK)of the products of PCR with two sets of Aac-specific primers, viz. BX-L1F/BX-R5F and BX-L1F/BX-S-R2R (Bahar et al., 2008), or the set 63f/1389r (Osborn et al., 2000) amplifying part of the 16S rDNA region, verified the isolates as Aac.In Rep-, Eric- or Box-PCR, the isolates from plants and Aac reference strains produced similar banding patterns. Koch’s postulates were fulfilled on seedlings and fruits of the above mentioned cucurbits with all isolates from plants. One such isolate was deposited in the Benaki Phytopathological Institute Culture Collection as BPIC2124. This is the first report confirming Aac naturally infecting watermelon plants and fruits in Greece.

 

Figure 1: Watermelon fruit naturally infected by Acidovorax avenae subsp. citrulli, showing irregular, water-soaked lesions and brown cracks on the surface

 

Figure 2: Section of watermelon fruit naturally infected by Acidovorax avenae subsp. citrulli, showing water-soaked areas in the rind underneath the surface lesions and watery rot of the flesh.

 

Figure 3: Young grafted watermelon plant naturally infected by Acidovorax avenae subsp. citrulli

 

Figure 4: Leaf of a young grafted watermelon plant naturally infected by Acidovorax avenae subsp. citrulli, showing symptoms of brown, angular, necrotic spots and larger necrotic areas

Acknowledgements

The authors wish to thank Dr S. Burdman for providing the Aac reference strains: W1, M1 (Bahar et al., 2008).

---

References

Bahar O, Efrat M, Hadar E, Dutta B, Walcott RR, Burdman S, 2008. New subspecies-specific polymerase chain reaction-based assay for the detection of Acidovorax avenae subsp. citrulli. Plant Pathology 57, 754-763.

Osborn AM, Moore ERB, Timmis KN, 2000. An evaluation of terminal-restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analysis for the study of microbial community structure and dynamics. Environmental Microbiology 2, 39-50

طبقه بندی باکتری های گیاهی Proteobacteria

 

Phylum "Proteobacteria"

Class Alphaproteobacteria"
Order Rhizobiales  

Family Beijerinckiaceae
Beijerinckia - Chelatococcus - Methylocapsa - Methylocella - Methylovirgula

Family Bradyrhizobiaceae
Afipia - Agromonas - Balneimonas - Blastobacter - Bosea - Bradyrhizobium - Nitrobacter - Oligotropha - Rhodoblastus - Rhodopseudomonas    

Family Rhizobiaceae
Agrobacterium - Allorhizobium - Carbophilus - Chelatobacter - Ensifer - Kaistia - Rhizobium - Sinorhizobium  

Family Xanthobacteraceae
Ancylobacter - Azorhizobium - Labrys - Pseudolabrys - Pseudoxanthobacter - Starkeya - Xanthobacter 

Unclassified Rhizobiales
Amorphus

Order Rhodobacterales  

Order Rhodospirillales  

Order Rickettsiales

Order Sneathiellales

Family Sphingomonadaceae
Blastomonas - Erythromonas - Novosphingobium - Rhizomonas (rejected name) - Sandaracinobacter - Sandarakinorhabdus - Sphingobium - Sphingomonas - Sphingopyxis - Sphingosinicella - Zymomonas

Class Betaproteobacteria

Order Burkholderiales

Family Alcaligenaceae
Achromobacter - Advenella - Alcaligenes - Azohydromonas - Bordetella - Brackiella - Castellaniella - Derxia - Kerstersia - Oligella - Parasutterella - Pelistega - Pigmentiphaga - Pusillimonas - Sutterella - Taylorella - Tetrathiobacter

Family Burkholderiaceae
Burkholderia - Chitinimonas - Cupriavidus - Lautropia - Limnobacter - Pandoraea - Paucimonas - Polynucleobacter - Ralstonia - Thermothrix - Wautersia

Family Comamonadaceae
Acidovorax - Alicycliphilus - Brachymonas - Caenimonas - Caenibacterium - Caldimonas - Comamonas - Curvibacter - Delftia - Diaphorobacter - Giesbergeria - Hydrogenophaga - Hylemonella - Lampropedia - Macromonas - Malikia - Ottowia - Pelomonas - Polaromonas - Pseudacidovorax - Ramlibacter - Rhodoferax - Roseateles - Schlegelella - Simplicispira - Tepidicella - Variovorax - Verminephrobacter - Xenophilus  -

Unclassified Burkholderiales  -  - Rhizobacter -  - Xylophilus

Order Nitrosomonadales

Gallionella

Family Nitrosomonadaceae
Nitrosolobus - Nitrosomonas - Nitrosospira

 

قارچ خوراكي و ميكوريز Cantharellus cibarius با نام محلي زرد كيجا از جنگلهاي ايران

 نام زرد كيجا يك نام مازندراني براي اين قارچ است كه كيجا به معناي دختر (ريكا به معناي پسر) و زرد نيز بخاطر رنگ قارچ مي باشد. نام انگليسي اين گونه Cantherelle و  The girolle مي باشد و از گروه قارچهاي Chanterelles بوده و از خانواده Cantharellaceae مي باشد. 

اعترافات شب قدر

سلام

اول این و بگم که من تو ماه رمضون هر شبم شبه قدره جون هر شب تا سحر بیدارم

گاهی بر میگردم و به عدم موفقیت هام نگاه میکنم

فقط یه دلیل توش میبینم و اون شرک به خداست

دوستان و عزیزان

یه موقعی یه امتحان مهم داشتم

اون امتحانی بود که صد شرکت کننده داشت و دو سه برنده

یکی از برگزارکنندگان اون امتحان از دوستان من بود

من بسیار علاقمند بودم تا تو اون امتحان قبول بشم

مدت زیادی هم مطالعه کرده بودم

پس از برگزاری امحان با اینکه امتحانم خیلی خوب بود اما شیطان وسوسه ام کرد

من رو مقداری از مسیر اعتماد و توکل به خدای آفریدگار دور کرد و یه تماسی با دوستم گرفتم و ازش خواستم که هوای من رو داشته باشه

ای وای بر این نفس

آیا خداوند برای موفقیت کافی نبود

آیا جز اراده خداوند هیچ اراده دیگری بر سرنوشت ما موثر است

آیا هیچ خیر خواهی خیر خواه تر از خدا وجود دارد

بعد از این که در کمال ناباوری قبول نشدم به یاد داستانی افتادم که خداوند نقل کرد

زمانی که یوسف در زندان لحظه ای از یاد خدا غافل شد و از اون زندانی که در حال ازاد شدن بود خواست که در نزد شاه برای او وساطت کند تا آزاد شود اما نه تنها آزاد نشد بلکه چندین سال دیگر نیز تنبیه شد

ای پروردگار مهربان

از گناه من در گذر که به اشتباه خود پی بردم ودر نزد تو و در نزد بندگانت جهت هوشیار باش ایشان معترفم

خداوندا هیج موثری در عالم غیر تو موجود نیست

به تو ایمان داریم و به تو توکل میکنیم

شیطان را دشمن میداریم که او بزرگترین دشمن ماست

یا رب درگذر

خدا بزرگترین است

 

حفظ آبروی مومن و مسلمان

دوستان

یکی از بزرگترین گناهان در نزد پروردگار بردن آبروی مومن است

بسیار هوشیار باشید آبروی مومنین را حفظ کنید تا خداوند آبروی شما را حفظ کند

روزی به جمع پیامبر بزرگ منش(سلام خدا بر او) و نزدیکان خبر آوردند که در فلان جا دو نفر مشغول زنا هستند

پیامبر در میان یاران رو به امام گرانسنگ علی( درود خدا بر او) نمود و ایشان را برای رسیدگی مامور کردند

ایشان پس از بازگشت گفتند من زمانی که چشم گشودم کسی را ندیدم

خبر رسان قسم یاد کرد که مطمئن است که دو نفر آنجا مشغول زنا بودند

پیامبر مجدد از علی جویا شد. ایشان گفت من در را باز کردم در حالی که چشمانم بسته بود و زمانی که چشم گشودم کسی را آنجا ندیدم.

پیامبر فرمود به همین جهت تو را فرستادم.

عزیزان این رسم و منش بزرگان است: حفظ آبرو

اگر ذره ای از روز جزا واهمه دارید  حفظ آبروی مومنین کنید  پرده دری نکنید

فکر نکنید که با کوچک کردن دیگران بزرگ میشوید

و بدانید که بزرگی از آن خداست و تنها به اهل تقوی عنایت میگردد

خداوند مدافع مومنین است

در جایی خواندم

در لحظه ای که مومنی لغزش کند و مشغول گناهی گردد خداوند به فرشتگان دستور میدهد که بالهای خود را باز کنید تا عالم بالا گناه بنده ام را نبینند

بندگان خدا

آنکه سرور و مولای ماست اهل عفو و بخشایش است

ای انسانها چرا از بردن آبروی دیگران نمیترسید

بدتر از آن اینکهُ مومنی پاکمنش را با تهمت بی آبرو کنیم آن هم در جهت منافع مادی و دنیوی

کسب جاه و مقام دنیوی  فراموشی خدا

پناه بر خدا ُ پناه بر خداُ ُ پناه بر خدا

خدایا تو بزرگترینی رحم کن بر این بنده کوچکترین

نکات اخلاقی

سلام

به دوستان و خوانندگان عزیز وبلاگ

از این پس قصد دارم علاوه بر مطالب علمی برخی مسائل اخلاقی را هم در وبلاگم بگنجانم

امیدوارم پروردگار راضی باشد و از تقصیرات و کوتاهی های ما در گذرد

اول اینکه بنده خدا باشیم این جمله کوتاه بسیار پر معنی و عمیق است

یکی از معانی بسیار نزدیک آن این است که بنده نفس خود نباشیم و بنده انسان های دیگر نباشیم

عزیزان بنده خدا باشیم  فقط بنده خدا  غیر از خدا هیچ کس شایسته اطاعت نیست

حتی در مورد پدر و مادر که بسیار توصیه شده است به نیکی و احسان به آنها پروردگار میفرماید در مواردی که شما را به امری خلاف دستورات الهی فرمان میدهند اطاعت نکنید

دوستان: بنده خدا باشید او به شما روزی میدهد و بخاطر پول و مقام دنیا بندگی بندگان ناصالح نکنید

 بخاطر پول و مقام نافرمانی خدا نکنیم رضای خدا بسیار بالاتر از رضایت مقامداران و ثروتمندان اهل هوای نفس میباشد

خدا بزرگترین است

ادامه دارد...

 

 

سایت بسیار جالب در مورد تریکودرما

ادرس سایت

گونه های تریکودرما

Hypocrea andinensis - Hypocrea ceramica - Hypocrea cremea - Hypocrea cuneispora - Hypocrea estonica - Hypocrea neorufa - Hypocrea nigrovirens - Hypocrea patella - Hypocrea semiorbis - Hypocrea stilbohypoxyli - Hypocrea surrotunda - Trichoderma aggressivum - Trichoderma arundinaceum - Trichoderma asperellum - Trichoderma atroviride - Trichoderma aureoviride - Trichoderma brevicompactum - Trichoderma citrinoviride - Trichoderma crassum - Trichoderma erinaceum - Trichoderma fasciculatum - Trichoderma fertile - Trichoderma gamsii - Trichoderma ghanense - Trichoderma hamatum - Trichoderma harzianum - Trichoderma koningii - Trichoderma koningiopsis - Trichoderma longibrachiatum - Trichoderma minutisporum - Trichoderma oblongisporum - Trichoderma ovalisporum - Trichoderma polysporum - Trichoderma pseudokoningii - Trichoderma pubescens - Trichoderma reesei - Trichoderma saturnisporum - Trichoderma spirale - Trichoderma strictipile - Trichoderma strigosum - Trichoderma stromaticum - Trichoderma tomentosum - Trichoderma virens - Trichoderma viride - Trichoderma viridescens

نارون

درخت نارون ( لی ؛ اوجا ) از وبلاگ گیلانیکا

نارون با نام علمی  Ulmus minor و در زبان گیلکی آن را " لی " و مازندرانی ها آن را " اوجا " می نامند.

نارون, درخت یا درختچه ای است که پوست آن در وهله ی اول صاف است.

 و پس از مدتی, پوست درخت رگه رگه می شود ( رگه طولی ).

 

شاخه های آن پوشیده از برگ های متناوب بیضی و دارای دمبرگ است. پهنک برگ آن قرینه نیست و دندانه های زیادی دارد.

دسته های گل آن قبل از روییدن برگ ها, روی شاخه های کوتاه می شکفد. عمل گرده افشانی این گیاه به کمک باد انجام می شود.

میوه ی آن پس از خشک شدن به سرعت از غلاف خود بیرون نمی آید.

این گیاه در حاشیه بیشه زارها و جنگل های مخلوط و مرطوب در ارتفاعات پایین می روید. نارون را غالباً در پارک ها و باغ ها می کارند.

پوست این گیاه از نظر پزشکی دارای ارزش است. نخست, شاخه های جوان را برش طولی داده, سپس آن ها را با دست جدا می کنند ( قطر شاخه حدود یک سانتیمتر).

علائم اسکب مرکبات بسیار شبیه به شانکر باکتریایی مرکبات در علی آباد دیده شد

علائم ملانوز مرکبات روی میوه

ملانوز مرکبات

راه تشخیص ویرویید ها

برای تشخیص ویرویید ها بهتر است هم از گیاه ایندیکیتور و هم از پرایمر اختصاصی استفاده شود

Plant parasitic nematodes

Plant parasitic nematodes associated with alfalfa in Hamadan Province.

 

Z. Hassanzadeh Khalifehkandi¹, A. Karegar Bideh² and A. Kheiri³

1, 2- Department of plant protection, Faculty of Agriculture, Bu- Ali Sina university

3- Faculty of Agriculture, Tehran university

Alfalfa with over 44277 hectares area in Hamadan Province is an important field crop in this area. There wasn’t any comprehensive research about the plant parasitic nematodes associated with alfalfa, therefore in 2002, fifty five soil samples were collected from alfalfa field of several locations in this province. Nematodes extracted by the centerifugal-flotation method, killed and fixed by hot FP 4:1, processed to anhydrous glycerin by the modified Sainhorst method (De Grisse, 1969). The nematodes were mounted on slides and examined by light microscope. In this survey over 25 known species belonging to 16 genera of order Tylenchida Thorne, 1949 were identified as follows:

Amplimerlinius globigerus, Boleodorus thylacyus, Criconema mutabile, Criconemella antipolitana, Criconemella ornate, Coslenchus costatus, Coslenchus franklinae, Coslenchus polygyrus, Ditylenchus dipsaci, Geocenamus brevidens, Geocenamus microdorus, Geocenamus rugosus, Helicotylenchus digonicus, Helicotylenchus dihystera, Helicotylenchus vulgaris, Irantylenchus vicinus, Meloidogyne sp., Neopsilenchus magnidens, Paratylechus tateae, Paratylenchus sp., Pratylenchus neglectus, Pratylechoides leiocauda, Pratylenchoides ritteri, Psilenchus iranicus, Psilenchus hilarulus, Trophurus ussuriensis and Zygotylenchus guevarai.

Moreover some species of Aphelenchus, Aphelenchoides, Basiria, Filenchus, Meloidogyne and Paratylenchus were found that will be identified later. Pratylenchoides leiocauda is the first record of Iran. This survey showed that the Criconemella antipolitana, Geocenamus brevidens, Helicotylenchus vulgaris and Pratylenchus neglectus, among all the identified species, were the most common in the province.

List of AFLP primers

List of AFLP primers:

Adapters:

1)MseI-1: 5' -gAC gAT gAg TCC TgA g-3'

2)PstI-1:   5 '-gAC TgC gTA ggT gCA-3'

3)EcoRI-1: 5'-CTC gTA gAC TgC gTA CC-3'

#1,2,3 should be dephosphorilated in 5'end.

 

4)MseI-2: 5' -TAC TCA ggA CTC AT-3'

5)PstI-2:   5' -CCT ACg CAg TCT ACg Ag-3'

6)EcoRI-2: 5'-AAT Tgg TAC gCA gTC TAC-3'

 

PstI primers:

1)   5'-gAC TgC gTA ggT gCA g-3'

2)   5'-gAC TgC gTA ggT gCA gA-3'

3)   5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAA-3'

4)   5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAAA-3'

5)   5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAAC-3'

6)   5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAAg-3'

7)   5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAAT-3'

8)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA gACA-3'

9)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA gACC-3'

10)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA gACg-3'

11)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA gACT-3'

12)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAgA-3'

13)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAgC-3'

14)   5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAgg-3'

15)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA gAgT-3'

16)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA ggCA-3'

17)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA ggCC-3'

18)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA ggCG-3'

19)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA ggCT-3'

20)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA ggTA-3'

21)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA ggTC-3'

22)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA ggTG-3'

23)  5'-gAC TgC gTA ggT gCA ggTT-3'

MseI primer:

1) 5'-gAT gAg TCC TgA gTA A-3'

2) 5'-gAT gAg TCC TgA gTA AC-3'

EcoRI Primers:

     1) 5'-gAC TgC gTA CCA ATT CA-3' 

برخی منابع کارشناسی ارشد بیماریهای گیاهی

1-گیاه شناسی: جزوه دكتر وزوایی دانشگاه تهران -جزوه دكتر صانعی شریعت پناهی

2-قارچ شناسی:مبانی قارچ شناسی الكسوپلوسی-جزوه دانشگاه صنعتی اصفهان-جزوه دانشگاه ارومیه

3-بیماری شناسی:بیماری های گیاهان زراعی دكتر اخوت-جزوه بیماری های زراعی دانشگاه شیراز-جزوه بیماری های درختان میوه دانشگاه شیراز--جزوه ویروس شناسی دانشگاه شیراز-جزوه باكتری شناسی دانشگاه شیراز-جزوه باكتری شناسی دانشگاه شیراز

4-اصول مبارزه با بیماری ها:كتاب بیماری های دكتر روستایی-كتاب دكتر آهومنش-جزوه احمد زاده دانشگاه تهران

5-سم شناسی:جزوه تهران دكتر شریفی-كتاب دكتر رخشانی-جزوه دانشگاه صنعتی اصفهان

خودتان قضاوت کنید

با سلام

 

استاد ما خیلی سعی کردیم تا تحقیق خوبی خدمت شما بدیم امیدوارم که مورد قبول شما قرار گرفته باشد

 

استاد ما زن وبچه داریم وگرگان مستاجریم وخرج زندگی را خودمان می کشیم (با مسافر کشی) و نمیدونیم

 

اگر درس شما را بیافتیم با توجه به شهریه 70000 هزارتومانی این درس چگونه ترم بعد ثبت نام کنیم

 

استاد هر چیز دیگهای هم غیر تحقیق بخواین مثل نمونه برای شما می اوریم فقط یک مساعدتی کنید تا این

 

درس را نیفتیم .

 

 

ببخشید بی ادبی کردم .

First report of olive knot caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi on olives (Olea europaea)

Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi was identified as the cause of galling on olives (Olea europaea), cv. Barnea in South Australia in May 2003 from a property at Greenfields ~10 km north of Adelaide. The bacterium was recovered from galls on 2-year-old olive trees (cv. Barnea) showing symptoms consistent with those attributed to olive knot. Following a targeted survey of cv. Barnea, further infections were located on 2 to 5-year-old trees in four other plantings in South Australia. This is the first record of olive knot in Australia

تشخيص ، پراكندگي و الگوي الكتروفورزي ويروس تريستزاي مركبات (CTV) در جنوب ايران

وجود ويروس تريستزاي مركبات (Citrus tristeza virus, CTV)، براساس علائم روشني رگبرگ در ليموترش و ساقه آبله‌اي در نارنگيهاي پيوند شده روي ليموترش ، مشاهدهء پيكره‌هاي رشته‌اي خمش‌پذير با الكترون ميكروسكپي عصارهء اين گياهان و آزمايش سرولوژيكي اليزا (DAS-ELISA) در استانهاي فارس و بوشهر به اثبات رسيد. ويروس از بافتهاي درختان نارنگي محلي پيوند شده روي ليموترش كه به طور طبيعي آلوده شده بودند، به وسيلهء دوبار رسوب دادن با پلي‌اتيلن گليكول (PEG) و سپس يك بار سانتريفوژ كردن در ستون داراي شيب چگالي مخلوط سوكروز و سولفات سزيوم، خالص‌سازي شد. آمودهء خالص‌سازي شده داراي طيف جذبي مشابه طيف جذبي نوكلئوپروتئينها بود و مشاهدهء الكترون ميكروسكپي اين آموده وجود پيكره‌هاي رشته‌اي خمش‌پذير را نشان داد. همچنين آزمايش اليزا وجود ويروس تريستزا را در اين آموده اثبات كرد. با تزريق زيرجلدي ويروس خالص شده به خرگوش ، آنتي‌سرمي عليه آن توليد شد. آنتي‌سرم بدست آمده پس از جذب با عصارهء گياه سالم در آزمايش نشت دوطرفه در آگار حاوي SDS فقط در مقابل نمونه‌هاي آلوده به CTV يك خط رسوب تشكيل داد. اين آنتي‌سرم پس از جذب با آمودهء گياه سالم و جداسازي گاماگلوبولين و تهيه آنتي‌بادي متصل به آنزيم در آزمايش DAS-ELISA مورد استفاده قرار گرفت كه در اين آزمايش ، استفاده از رقتهاي 1/900 آنتي‌بادي و 1/300 آنتي‌بادي متصل به آنزيم مناسب تشخيص داده شد. الكتروفورز پروتئين آموده‌هاي خالص‌سازي شده در ژل‌پلي‌اكريل آميد داراي دودسيل سولفات سديم (SDS-PAGE) در مورد تمام جدايه‌ها دو نوع پروتئين نشان داد. يكي از پروتئينها با وزن مولكولي 35500-36300 دالتون در عصارهء گياه سالم نيز مشاهده مي‌شد ولي پروتئيني با وزن مولكولي 22500-23000 دالتون فقط در عصارهء گياهان آلوده وجود داشت . بررسي پوست تنه در قسمت پايه، پوست تنه در قسمت پيوندك ، پوست شاخه‌هاي دوساله، پوست شاخه‌هاي جديد، دمبرگ و آلبيدو ميوهء 11 اصله نارنگي پيوند شده روي ليموترش با روش اليزا نشان داد كه پوست تنه در قسمت پيوندك و پوست شاخه‌هاي دوساله بيشترين مقدار ويروس را دارا هستند. پراكندگي CTV در مناطق مهم مركبات كاري استان‌هاي فارس و بوشهر، بر روي گونه‌ها و رقمهاي مختلف مركبات با استفاده از روش اليزا مورد بررسي قرار گرفت . از 646 درخت مورد آزمايش 242 درخت آلوده تشخيص داده شد. در ميان مناطق مختلف جهرم، خفر، كازرون، فسارود و جنت‌شهر داراب از استان فارس و دالكي، رودفارياب ، خائيز و جم از استان بوشهر و در ميان ارقام مختلف پرتقال، ليموشيرين، ليموترش ، نارنگي محلي، آنشو، نارنگي خاري و نارنگي كلمانتين آلوده تشخيص داده شد. آزمايشهاي انجام شده نشان داد پراكنش CTV در مناطق مختلف و روي رقمهاي مختلف مركبات جنوب ايران نسبتا وسيع است . وجود درختان ليموترش آلوده در نقاط دورافتاده نشان مي‌دهد كه CTV نه تنها احتمالا در سالهاي اخير همراه با رقمهاي جديد مركبات وارد منطقه شده، بلكه ممكن است از زمانهاي خيلي دور نيز در منطقه وجود داشته است . همچنين آلودگي ليموترش امكان وجود ناقل ويروس در منطقهء جنوب كشور را مطرح مي‌سازد. بنابراين آنچه كه لازم است از اين پس مورد مطالعه قرار گيرد علاوه بر پيگيري نقش ناقلين احتمالي، ميزان خسارت ناشي از CTV در درختان مركبات و نوع سويه‌هايي است كه در منطقهء جنوب وجود دارد.

ردیابی بیماری تریستزای مرکبات

در این تحقیق سلامت ارقام مهم تجاری منبع پیوندک و ارقام وارداتی در ایستگاه های مرکبات رامسر(60 مورد)، خرم آباد تنکابن(35 مورد)،  کترا(حدود 300 مورد) و تمامی نهالهای مادری وارداتی از کشور فرانسه از نظر بیماری تریستزا با روش ایمیونوپرینتینگ و الایزا مورد بررسی قرار گرفتند. بدین صورت که در فصل گل، جمع آوری گلهای بسته از چهار جانب درختان مورد نظر انجام شد. گلبرگهای گل جدا شده و لکه گذاری کاغذهای نیتروسلولز به منظور انجام آزمون ایمیونوپرینتینگ با استفاده از برش مقطع تخمدان صورت گرفت. دو خانه از میان جدول ترسیم شده روی کاغذها برای هر نمونه در نظر گرفته شده و در هر یک از دو خانه 4-3 لکه ایجاد شد. همچنین دو خانه برای شاهد مثبت و یک خانه برای شاهد منفی در نظر گرفته شد. این کاغذها  در شرایط آزمایشگاه به مدت دو ساعت در معرض محلول 1% آلبومین گاوی قرار گرفته و پس از سه بار شستشو، سه ساعث در آنتی بادی نشاندار ویروس مربوطه غوطه ور و مجددا شسته شدند. مدتی پس ازاضافه کردن سوبسترای NBT-BCIP  بقایای رنگ رسوب ارغوانی در ناحیه آوندی نقوش مربوط به شاهد مثبت و نمونه های آلوده به ویروس ظاهر شد و در نمونه های سالم واکنش تغییر رنگ مشاهده نشد. آزمون الایزا برای تائید موارد مشکوک در ایمیونوپرینتینگ یا به عنوان روش جایگزین مورد استفاده قرار گرفت.

     پس ازاضافه کردن سوبسترای NBT-BCIP  بقایای رنگ رسوب ارغوانی در ناحیه آوندی نقوش مربوط به شاهد مثبت( لایم آلوده موجود در گلخانه موسسه) ظاهر شد و در نمونه های سالم واکنش تغییر رنگ مشاهده نشد.نتایج مشابه در آزمون الایزا حاصل شد. در بین درختان مادری و نهالهای وارداتی از فرانسه تست شده با آنتی بادی بیوربا هیچ کدام به ویروس تریستزای مرکبات آلوده نبودند. در ضمن  با بررسی­های به عمل آمده مشخص شد که می توان از تخمدان گل در ردیابی ویروس تریستزای مرکبات در آزمون ایمیونوپرینتینگ و الایزا  استفاده نمود.

                                           

خالص‌سازي، توليد آنتي‌سرم و توسعه يك سيستم بيوتكنولوژيكي حساس به منظور تشخيص دقيق و سريع ويروس تريست

يك گياه مركبات با علائم مشكوك به ويروس تريستزا در باغات مهدشت ساري انتخاب و وجود ويروس مزبور در آن به روش Indexing به اثبات رسيد. گياه مزبوربعنوان منبع اوليه ويروس انتخاب و از آن پيوندك آلوده تهيه گرديد. بمنظور تكثير ويروس ، پيوندكهاي مزبور به 150 اصله نهال ليمو آب پيوند زده شد و نهالها در گلخانه نگهداري گرديدند، تك‌تك نهالها از نظر بيماريهاي ويروسي و شبه ويروسي ديگر از جمله Exocortis، پسورز و نقش حلقوي به روش متداول Indexing مورد آزمايش قرار گرفتند و معلوم شد كه نهالهاي مورد نظر فقط آلوده به ويروس تريستزا هستند و در گياهان محكي كه مورد استفاده قرار گرفته بودند هيچگونه علائم آلودگي ديگر مشاهده نگرديد، در آينده بافت آلوده نهالهاي پيوند زده شده، بمنظور خالص‌سازي ويروس مورد استفاده قرار خواهند گرفت .

First report of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus causing bacterial ring rot of potato in

Ş. Altundağ¹, A. Karahan^1*, A.O. Kılınç¹ and M. Özakman²   

¹ Plant Protection Central Research Institute, Gayret Mahallesi, Fatih Sultan Mehmet Bulvarı No: 66, Yenimahalle 06172, Ankara, Turkey
² Gennova Pesticide Company, Bekir Saydam Cad., No: 31, Pancar, Torbalı, İzmir, Turkey

* [e-mail]

Accepted for publication 04 Dec 2008

During the 2007 seed potato monitoring programme in Turkey, 336 tuber samples from Kayseri province were tested for the presence of ring rot and brown rot diseases according to the EC Directives 93/85/EEC (Anon., 1993) and 98/57/EC (Anon., 1998). Three samples gave a positive immunofluorescence test (IF) result for the ring rot pathogen, Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (Spieckermann & Kotthoff) Davis. et al.(Cms). Tuber heel end extracts were plated onto NCP-88 medium. Creamy-white, smooth, mucoid-fluidal colonies were selected and purified. External symptoms were observed on tubers of all three samples (two of cv. Soleia and one of cv. Safrane) as sunken and cracked areas (Fig. 1). When tubers were cut transversely, typical symptoms were seen through the vascular ring of tubers as a brown cheesy decay. Bacterial ooze was expressed when tubers were squeezed (Fig. 2). A positive IF result was obtained directly from the ooze. Isolates hydrolysed aesculin and produced catalase. They did not produce acid from glycerol, lactose, rhamnose and salicin. They gave negative results for oxidase activity, growth at 37°C, urease activity, starch hydrolysis, tolerance of 7 % NaCl, indole production and gelatine liquefaction.

Suspensions of pure colonies in water (c. 10⁹ cfu per ml from each of the three samples were used for real-time PCR (Schaad et al. ,1999), with Ct values of 16.53, 16.21 and 32.2. Suspensions (10⁶ cfu/ml) were injected into stems of ten Solanum melongena plants (cv. Black Beauty) at leaf stage 3. Control plants were inoculated with sterile water. Plants were incubated at 21°C and 70-80 % humidity. First symptoms were observed as dark green areas on leaves after ten days followed by wilting and necrosis (Figure 3). Cms was re-isolated and identified.

An intensive survey in 1988-1989 had shown that the potato growing areas of Turkey were free of the ring rot pathogen (Benlioğlu et al., 1991). This is the first report of Cms in Turkey. Strict control measures have been taken in contaminated and potentially contaminated fields since Cms is a regulated quarantine organism in Turkey.

 

 

---

References

Anon., 1993. Council Directive 93/85/EEC on the control of potato ring rot . Official Journal of the European Communities L 259, 1-25.

Anon., 1998. Council Directive 98/57/EC on the control of Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi et al. Official Journal of the European Communities L 235, 1-39.

Benlioğlu K, Öktem Y.E, Özakman M, 1991. Bacterial diseases of potatoes in the major potato-growing areas in Turkey. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin 21, 67-72.

Schaad N.W, Berthier-Schaad Y, Sechler A, Knorr D, 1999. Detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus in potato tubers by Bio-PCR and an automated real-time fluorescence detection system. Plant Disease 83, 1095-1100

First report of citrus huanglongbing disease on orange in Iran

M. M. Faghihi¹, M. Salehi², A. Bagheri¹ and K. Izadpanah^3*

¹ Hormozgan Agriculture and Natural Resources Research Centre, Iran
² Fars Agriculture and Natural Resources Research Centre, Iran
³ Department of Plant Protection, College of Agriculture, Shiraz University, Shiraz, Iran 

*[e-mail] 

Huanglongbing (HLB), also known as greening, is a destructive disease of citrus that may limit production of this crop in many parts of Asia, Africa and South America. HLB is caused by a non-culturable phloem-limited bacterium of the genus ‘Candidatus Liberibacter’. Three Candidatus species of Liberibacter, namely, ‘Ca. L. asiaticus’, ‘Ca. L. africanus’ and ‘Ca. L. americanus’, have been identified (Bové, 2006). The psyllid Diaphorina citri, vector of ‘Ca. L. asiaticus’ was first detected in December 1997 in Iran in an area close to the border with Pakistan (Bové et al., 2000). Since then, high populations of D. citri have been found in citrus plantations of Hormozgan and Kerman provinces in southern Iran (Bové, 2006). Citrus trees in this region exhibit typical HLB symptoms including mottling of leaves and yellowing of shoots. In the present study leaf samples from 20 symptomatic and 20 symptomless Valencia sweet orange trees (Citrus sinensis) and over 50 psyllid samples were collected from various locations in Sistan-Baluchistan and Hormozgan provinces and total DNA was extracted using the CTAB (cetyltrimethylammonium bromide) method. DNA samples were tested for presence of ‘Ca. L. asiaticus’ by nested PCR using primer pairs F1 (5’-TGAATTCTTCGAGGTTGGTGAGC-3’)/R1(5’-GAATTCGACTTAATCCCCACCT-3’) as the first set and F2(5’ GCGTTCATGTAGAAGTTGTG-3’) / R2(5’-CCTACAGGTGGCTGACTCAT-3) as the second set. Both primer pairs were designed based on the published beta-operon of ribosomal protein encoding sequence of ‘Ca. L. asiaticus’ (Villechanoux et al. 1993). Nested PCR resulted in amplification of a 400 bp product from five out of 20 leaf samples and 26 out of 50 psyllid samples. No amplicons were obtained from symptomless sweet orange trees and psyllid samples reared on healthy sweet orange seedlings. The amplified fragment from a psyllid sample was cloned and sequenced (GenBank Accession No. FJ172759). BLAST search showed 100% identity with corresponding sequences of ‘Ca. L. asiaticus’ (M9439, AY34200 and EU078703). This is the first report on the occurrence of HLB disease in Iran. The disease appears to be widely distributed in citrus growing regions of southern Iran and may be a component of citrus decline in this area.

---

References

Bové JM, 2006. Huanglongbing: A destructive, newly–emerging, century-old disease of citrus. Journal of Plant Pathology 88, 7-37.

Bové JM, Danet G L, Bananej K, Hassanzadeh N, Taghizadeh M, Salehi M, Garnier M, 2000. Witches' broom disease of lime (WBDL) in Iran. In Yokomi, RH, da Graça, JV, Lee, RF, eds. Proceedings of the 14th Conference of the International Organization of Citrus Virologists, 300-309. Riverside, CA, USA: IOCV.

Villechanoux S, Garnier M, Laigret F, Renaudin J, Bové JM, 1993. The genome of the non-cultured, bacterial-like organism associated with citrus greening disease contains the nusG-rplKAJL gene cluster and the gene for a bacteriophage type DNA polymerase. Current Microbiology 26, 161-166.

Rathayibacter iranicus isolated from symptomless wheat seeds in Turkey

E. Postnikova¹, I. Agarkova², S. Altundag³, F. Eskandari¹, A. Sechler¹, A. Karahan³ A.K. Vidaver² W. Schneider¹, M. Ozakman³ and N.W. Schaad^1*

¹ ARS-USDA, Foreign Disease-Weed Science Research Unit, Ft. Detrick, Maryland, USA
² Department of Plant Pathology, University of Nebraska, Lincoln, Nebraska, USA
³ Plant Protection Research Institute, P.O. Box 49, Ankara, Turkey

*[e-mail]

Rathayibacter iranicus (Ri), originally reported in Iran in 1961 (Sharif, 1961), has not been reported outside Iran and only one strain is known to exist. Like R. tritici (Rt), Ri causes a gumming disease of wheat in association with the nematode Anguina tritici (Paruthi et al., 1989). During 2003, a survey of wheat seed for Rathayibacter species (RS) in Turkey using samples from 799 farmers in six provinces in Central Anatolia was conducted. The samples showed neither the brown to black galls typical of Anguina nor the yellowish galls typical of Ri and Rt. To determine the presence of RS, 120 g samples were washed in 100 ml of sterile 0.85% NaCl with 0.02% Tween 20 and plated onto 523 agar (Schaad et al., 2001) modified by adding 30 mg nalidixic acid, 15 mg polymixin B sulphate and 100 mg cycloheximide per litre. After incubation at 27º C for seven days, several typical colonies of RS were cloned by streaking onto YDC agar (Schaad et al., 2001). Twenty five strains were presumptively identified as RS based on a Gram positive reaction, oxidase negative reaction and yellow growth.

Three strains, TRS2 from Konya, TRS10 from Hisarkikaya, and TRS25 from Ankara, were used for further identification and speciation. The other 22 strains were archived for later studies. The type strains of Rt, (International Collection of Phytopathogenic Bacteria [ICPB] 70004^T; FH-5; CT 102^T) and Ri (ICPB 70005^T; FH-6 ^T; CI 148^T), were included as controls. All three strains were biochemically typical of Ri and Rt by producing acid from D-mannose, inulin, galactose, and mannitol.However, the strains failed to utilize acetate, or to hydrolyze casein, failed to grow in greater than 1% sodium chloride amended NBY, or on CNS agar, which is characteristic of Ri but not Rt (Davis & Vidaver, 2001). The new strains contained the fatty acids iso-14:0 and 16:0; anteiso 15:0 and 15:1, and 17:0, and 16:0, also typical of Ri. Identification of the three strains as Ri was further supported by 16s rDNA sequence similarities to Ri and Rt of 100%and 99.3%, respectively (GenBank Accession Nos. FJ595101 - Ri, ICPB 70005 and FJ595102 – Rt, ICPB 70004). Identification asRi was confirmed by AFLP analysis (EcoRI+0 and MseI+C) showing a pattern of 90% similarity to Ri but only 46% to Rt. This is the first report of Ri outside of Iran. Cultures have been deposited in the ICPB at Ft. Detrick, MD, USA, as ICPB 70146 (FH-154; TRS2), 70154 (FH-162; TRS10), and 70169 (FH-177; TRS25).

---

References

Davis M.J., Vidaver A.K., 2001. Gram Positive Bacteria, Coryneform Plant Pathogens. In: Schaad N.W., Jones J.B., Chun W., eds, Laboratory Guide for Identification of Plant Pathogenic Bacteria, 3rd Edn, St. Paul, MN, USA: APS Press, 218-234.

Paruthi I. J., Bajaj H.K., Bhatti D.S., 1989. Further observations on Anguina tritici (Nematoda) and Corynebacterium michiganense pv. tritici causing earcockle and yellow ear rot in wheat. Nematologica 35, 491-493.

Schaad N.W., Jones J.B., Chun W., eds, 2001. Laboratory Guide for Identification of Plant Pathogenic Bacteria, 3rd Edn, St. Paul, MN, USA: APS Press, 373 pp.

Scharif G., 1961. Corynebacterium iranicum sp. nov. on wheat (Triticum vulgare L.) in Iran, and a comparative study of it with C. tritici and C. rathayi. Entomologie et Phytopathologie Appliqués 19, 1-24.

First report of Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi causing olive knot in Syria

N. Alabdalla¹, F. Valentini¹, C. Moretti^2*, S. Essa³, R. Buonaurio² and M. Abu-Ghorra⁴

¹ Istituto Agronomico Mediterraneo, Via Ceglie 9, I-70010 Valenzano (Bari), Italy
² Dipartimento di Scienze Agrarie e Ambientali, sez. Arboricoltura e Protezione delle Piante, Via Borgo XX Giugno, 74, I-06121 Perugia, Italy
³ General Commission for Scientific and Agriculture Research, Lattakia Center, Lattakia, Syria
⁴ Division of Plant Pathology and Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Damascus, Syria

*[e-mail]

Accepted for publication 25 Mar 2009

During field surveys carried out in 2007 in the main Syrian olive (Olea europaea) growing areas, bacterial knot symptoms were observed on olive twigs and branches, with the highest incidence (70%) in the coastal region (Lattakia and Tartous). Bacterial colonies isolated from knots resembled those of Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi. Ten selected representative bacterial strains and the reference strains LMG 2209^T, CFBP 6012 and 6013 of P. savastanoi pv. savastanoi were subjected to identification tests. All strains were Gram negative, fluorescent on King’s medium B and had oxidative but not fermentative metabolism. They were negative for levan, oxidase, potato rot and arginine dihydrolase and positive for tobacco hypersensitivity. One-year-old olive plants (cvs. Nebali and Jlot) were inoculated by introducing bacterial suspensions (10⁸ cfu/ml) into wounds made in the bark with a sterile scalpel. All strains induced knots at the site of inoculation from 20 days onwards. Bacteria with characteristics identical to the original strains were re-isolated from inoculated plants. PCR analysis using primers specific for P. savastanoi pv. savastanoi, which amplify fragments of iaaL (Penyalver et al., 2000) and ptz (Powell & Morris, 1986) genes, generated amplicons of the expected size from all strains. Using BOX-, ERIC- and REP-PCR, we demonstrated that the isolates have a similarity of 87-98.9 % between themselves and with the reference strains. Based on morphological, biochemical, physiological and pathogenicity tests as well as molecular analyses, we can conclude that the Syrian strains belongs to P. savastanoi pv. savastanoi.

Although strains from Syria have previously been characterised with respect to their ability to produce auxin (Gardan et al., 1992), this is the first authoritative report of olive knot disease symptoms in Syria caused by P. savastanoi pv. savastanoi.

 

Figure 1: Agarose gel electrophoresis of REP-, BOX-, and ERIC-PC fingerprint patterns obtained from Pseudomonas savastanoi pv. 9, SYR 38, SYR 43, SYR 62, SYR 2, SYR 3, SYR 49, SYR 24, SYR 56, SYR 53 (lanes 1 - 10); CFBP 6012 (lane 11); CFBP 6013 (lane 12); LMG 2209T (lane 13); negative control (lane C). M = molecular weight marker DNA Ladder Mix (MBI Fermentas, Burlington ON, Canada).

Figure 2: Dendrogram derived from REP-, BOX-, and ERIC-PCR fingerprint data and obtained by cluster analysis (UPGMA) and Dice’s coefficient.

Acknowledgements

The authors would like to thank Mr. L. Bonciarelli for his excellent technical assistance.

---

References

Gardan L, David C, Morel M, Glickmann E, Abu-Ghorra M, Pettit A, Dessaux Y, 1992. Evidence for a correlation between auxin production and host plant species among strains of Pseudomonas syringae subsp. savastanoi. Applied and Environmental Microbiology 58, 1780-1783.

Penyalver R, García A, Ferrer A, Bertolini E, López MM, 2000. Detection of Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi in olive plants by enrichment and PCR. Applied and Environmental Microbiology 66, 2673-2677.

Powell GK, Morris RO, 1986. Nucleotide sequence and expression of a Pseudomonas savastanoi cytokinin biosynthetic gene: homology with Agrobacterium tumefaciens tmr and tzs loci. Nucleic Acids Research 14, 2555-2565.

First report of pathogenicity group 2 of Leptosphaeria maculans causing blackleg of oilseed rape in

A. Z. Mirabadi^1*, K. Rahnama² and A. Esmaailifar³

¹ Oilseeds Research & Development Company, Pasdaran Avenue Sari province, Iran
² Department of Plant Protections, GorganUniversity Agricultural Sciences&Natural Resources, Iran
³ Department of Plant Protections, Faculty of Agriculture and Natural Resources Islamic AzadUniversity, Arak

*[e-mail]

Accepted for publication 28 Apr 2009

Rapeseed (Brassica napus) is one of the most important oilseed crops in Iran with more than 200,000 ha planted in 2008. Phoma blackleg (Leptosphaeria biglobosa), pathogenicity group 1 (PG-1) or non-aggressive type, has been reported on rapeseed from Golestan province (Fernando et al., 2007). Recently, in some regions of Mazandaran and Golestan provinces of northern Iran,typical stem canker symptoms were observed with incidence ranging from 20 to 60%. During October and November 2008, ascospores were isolated from pseudothecia on infected rapeseed debris and cultured on V8-agar medium (Mengistu et al. 1993). Based on the description of Punithalingam & Holliday (1972), sporulating colonies were identified as Leptosphaeria maculans (Desmaz.) Ces. & de Not. (Anamorph Phoma lingam (Tode: Fr.) Desmaz.).

Eleven isolates of L. maculans were used for determining the pathogenicity group according to phenotypic interaction (PI) on rapeseed cultivars including Westar, Quinta and Glacier. Nine seven-day old seedlings of each cultivar were inoculated for each isolate and the test was repeated three times. Wounded cotyledons were each inoculated with 10µl of conidial suspensions at 2 x 10⁷ spores/ml. All plants were maintained in a growth chamber at 21° C (light) to 16° C (dark), with a 16-hour photoperiod and relative humidity of 95%. After 10 days, disease severity wasrated on a 0-9 scale (Williams, 1985) (Fig. 1).

Two isolates (Es-5 and Es-7) were classified as belonging to pathogenicity group PG2 and nine isolates as PG1. PG2 isolates showed PI reactions 0 to 2, 7 to 9 and 7 to 9 on Glacier, Quinta and Westar, respectively. In addition, cultivars Hyola401 and Okapi were highly sensitive to PG-2 isolates in the cotyledon assay. This is the first report ofthe occurrence of Leptosphaeria maculans PG-2 in Iran.

Figure 1: Phenotypic interaction (PI) of Leptosphaeria maculans isolates (Es-5 and Es-7) on five rapeseed cultivars after 10 days.

Acknowledgements

Special thanks to the Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) for providing the seeds needed for this testing.

---

References

Fernando WGD, Ghanbarnia K, Salati M, 2007. First report on the presence of phoma blackleg pathogenicity group 1 (Leptosphaeria biglobosa) on Brassica napus (canola/ rapeseed) in Iran. Plant Disease 91, 465.

Mengistu A, Rimmer RS, Williams PH, 1993. Protocols for in vitro sporulation, ascospore release, sexual mating, and fertility in crosses of Leptosphaeria maculans. Plant Disease 77, 538-540.

Leptosphaeria maculans. CMI descriptions of pathogenic Fungi and Bacteria. No. 331. Kew, UK: Commonwealth Mycological Institute.

Williams PH, 1985. Crucifer Genetics Cooperatives (CrGC) Resource Book. Madison, WI, USA: University of Wisconsin.

First report of a potato cyst nematode, Globodera rostochiensis, on potato, in Iran

M. Gitty¹ and Z. Tanha Maafi ²*

¹ Agricultural and Natural Resources Research Center of Hamadan, Iran
² Iranian Research Institute of Plant Protection, P.O. Box 1454, Tehran, 19395, Iran

*[e-mail]

Accepted for publication 05 May 2009

In June 2008 a few ware potato fields in Hamadan Province in the western part of Iran showed patches of about 20-200 m2of poor growth. Potato plants in these areas exhibited symptoms of severe stunting and nutrient deficiency along with yellow leaves and wilting (Fig. 1). Roots of infested plants showed white, golden mature females and brown cysts on their surface (Fig. 2). Cysts and second stage juveniles were extracted from soil and root samples.

The morphological and morphometrical characters of second stages juveniles and perineal area of cysts were examined by light microscope. The cysts showed the general characteristics of Globodera genus i.e. almost spherical body without vulval cone, circumfenestrate opening of the perineal area and subterminal anus, with the distance from anus to the vulval basin (n=25) 49.56 ± 9.68 (32-68) µm, the vulval basin diameter 15.24 ± 1.92 (10-17) µm, the Granek's ratio 3.27±0.61 (2.25-4.47), and the number of cuticular ridges between anus and vulval basin (n=16) 19±2.5 (15-24). Second stage juveniles (n=16) had stylet length 21.12±0.95 (20-23) µm with rounded knobs, tail length 52.7±2.9 (48-57) µm, and hyaline part of tail 28.12±3.53 (20-33) µm.

A molecular test was done for complementary diagnosis. DNA was extracted from several single cysts as described by Tanha Maafi et al. (2003) and amplified by species specific primers (Fullaondo et al., 1999). On the basis of the results obtained the cysts were identified as Globodera rostochiensis [Wollenweber, 1923 (Behrens, 1975)] (Wouts & Baldwin, 1998; OEPP/EPPO. 2004). The morphological diagnosis was confirmed by amplifying a single fragment of 315bp length which corresponded with Fullaondo et al., 1999. No amplification was produced with the specific primers for G. pallida. Potato cyst nematodes (PCNs) are considered quarantine pests in Iran and this is the first report of the genus Globodera and G. rostochiensis from Iran.

Figure 1: Patches of infested potato field showing poor growth

Figure 2: Mature females and cysts of Potato cyst nematode, Globodera rostochiensis on the root surface of potato plant

---

References

OEPP/EPPO, 2004. Globodera rostochiensis and Globodera pallida. PM 7/40(1),Bulletin OEPP/EPPO Bulletin34, 309 –314.

Fullaondo A, Barrena E, Viribay M, Barrena I, Salazar A, Ritter, E. 1999. Identification of potato cyst nematode species Globodera rostochiensis and G. pallida by PCR using specific primer combinations. Nematology 1, 157-163.

Tanha Maafi Z, Subbotin SA, Moens M, 2003. Molecular identification of cyst-forming nematodes (Heteroderidae) from Iran and a phylogeny based on the ITS sequences of rDNA. Nematology 5, 99-111.

Wouts WM, Baldwin JG, 1998. Taxonomy and Identification. In: Sharma SB, ed. The Cyst Nematodes. Dordrecht, The Netherlands: Kluwer Academic Publishers, 83-122

خصوصيات فنوتيپي استرين هاي ايراني ‏‎Erwinia amylovora ( Burill) Winslow et al. ,‎‏ عامل باكتريايي بي

                                                 محمدرضا افيونيان

در اين بررسي تعداد پنجاه استرين جدا شده از ميزبانهاي سيب ، گلابي ، به ، گل سرخ و ازگيل از مناطق قزوين ، تهران ، كرج ، هشتگرد ، طالقان ، خوي ، سلماس و اروميه مورد بررسيهاي فنوتيپي و الكتروفورز پروتئين و پلاسميد و حساسيت نسبت به آنتي بيوتيكها قرار گرفت . استرين ها لوان و كاتالاز مثبت ، قادر به تحريك واكنش فوق حساسيت در برگهاي توتون و شمعداني و توليد تراوشات باكترياييبر روي ميوه هاي نارس گلابي بودند . واكنش گرم و اكسيداز منفي بوده و قادر به احياي نيترات و يا توليد رنگ فلورسانت نبودند. همه استرين ها هوازي اختياري ، اوره آز منفي ، قادر به تحمل نمك طعام 5% و دماي 35 درجه سانتي گراد بودند . واكنش توليد مواد احياء كننده از ساكارز در تمامي استرينها مثبت بود . توليد استوئين پس از دو روز مثبت و پس از پنج روز منفي ثبت گرديد. ژلاتين به كندي هيدروليز شده ولي هيچكدام از استرينها قادر به هيدروليز نشاسته ، كازئين ، آرژي نين ، توئين 80 و يا اسكولين نبودند . توليد اندول ، گاز از گلوكز ، فنيل آلانين دي آميناز ، لستيناز ، فسفاتاز و يا توليد رنگ صورتي در محيط ‏‎YDC‎‏ در تمامي استرينها منفي بود . تمامي استرينها از گلوكز ، ساكارز، گالاكتوز ، مانيتول ، تري هالوز ، ريبوز ، ساليسين ، آرابينوز ، سلوبيوز ، اينوزيتول ، فروكتوز ، گليسرول ، سيترات ، سوكسينات و فومارات استفاده كرده و توليد اسيد يا قليا نموده و اكثرا توانايي مصرف فرمات را داشتند ولي قادر به مصرف اينولين ، اسيد نيكوتينيك ، نيكوتين آميد ، مالونات، تارتارات ، آسكوربات ، گلوكانات ، گالاكتيورونات ، پروپيونات ، اگزالات ، دي گلوتاميك اسيد ، لاكتات ، بنزوات ، استات و يا پلي پكتات سديم نبودند . نقوش الكتروفورز پروتئين همه استرينها يكسان بود و در الكترفورز ژل آگارز نيز تمامي آنها داراي دو نوار پلاسميدي با وزن هاي مولكولي مشابه بودند . تمامي استرين ها در آزمون نشت دو طرفه در آگار در برابر سه آنتي سرم مصرفي يك باند رسوبي قوي ايجاد نمودند. واكنش غير اختصاصي مشاهده نگرديد. آنتي ژن حاصل از باكتري كشته شده با حرارت ، واكنش قوي تر نسبت به آنتي ژن تيمار نشده ( سوسپانسيون باكتري زنده ) توليد نمود . كروماتوگرام حاصل از كروماتوگرافي ليپيدهاي استرين ها روي صفحه نازك سيليكاژل شامل سه لكه عمده بود و تفاوتي بين استرين ها مشهود نبود . بر اساس نتايج حاصله ، استرين ها باكتري عامل آتشك سيب و گلابي جدا شده از مناطق مختلف ايران در خصوصيات بررسي شده همانند ( هموژن ) و غير قابل تمايز بودند.

تعيين خصوصيات و تفكيك استرين هاي ايراني باكتري Erwinia amylovora با استفاده از روش هاي بيوشيميايي و

                                                              رضا اميدوار

بيماري آتشك درختان ميوه دانه دار گسترش جهاني داشته و در سال هاي اخير نيز خسارات هنگفتي به باغ هاي ميوه دانه دار در برخي مناطق ايران وارد كرده است. از آنجا كه بدون شناخت دقيق عامل بيماري مبارزه با آن مشكل خواهد بود، لزوم بررسي و شناخت دقيق عامل بيماري و تنوع ژنتيكي آن ضروري مي باشد. با توجه به اين كه تنوع ژنتيكي استرين هاي باكتري E,amylovora، جداشده از ميزبان ها و مناطق مختلف ايران بررسي نشده است، اين تحقيق به بررسي تنوع ژنتيكي جدايه هاي ايراني باكتري اختصاص يافت. جدايه هاي باكتريايي جمع آوري شده از ميزبان ها و مناطق مختلف جغرافيايي ايران، از لحاظ ويژگي هاي فنوتيپي و الگوي پروتئيني و همچنين تنوع ژنتيكي تعدادي از استرين ها با استفاده از نشانگر RAPD مورد بررسي قرار گرفت. انجام آزمون هاي فيزيولوژيكي و بيوشيميايي و مقايسه الگوي پروتئيني، وجود سطح تشابه بالايي را در ميان استرين ها آشكار ساخت. همچنين تمامي استرين ها در آزمايشات RAPD-PCR، الگوهاي يكساني توليد كردند. بنابراين مشخص گرديد كه استرين هاي ايراني E.amylovora از نظر ژنتيكي مشابه بوده و بر اساس منطقه جغرافيايي، ميزبان و سال جداسازي قابل تفكيك نيستند.

 

درخت انجیلی

Parrotia persica (Persian Ironwood) is a deciduous tree in the family Hamamelidaceae, the sole species in the genus Parrotia but closely related to the genus Hamamelis (Witch-hazels). It is native to northern Iran, where it is endemic in the Alborz mountains

.

لکه برگی های درخت اوکالیپتوس

Eucalypt leafspots Species:

Aulographina eucalypti (Ascomycete) (anamorph Thyrinula eucalypti)

Mycosphaerella cryptica (Ascomycete) (anamorph Colletogloeum nubilosum)

Mycosphaerella nubilosa (Ascomycete)

Mycosphaerella swartii (Ascomycete) (anamorph Sonderhenia eucalyptorum, syn. Hendersonia eucalyptorum)

Phaeophleospora eucalypti (Ascomycete) (syn. Kirramyces eucalypti, Septoria pulcherrima)

Phaeothyriolum microthyrioides (Ascomycete) (syn. Microthyrium eucalypti)

Pseudocercospora eucalyptorum (Ascomycete anamorph) (syn. Cercospora eucalypti)

Trimmatostroma bifarium (Ascomycete anamorph)

Trimmatostroma excentricum (Ascomycete anamorph

Fig, 13: Leafspots caused by Aulographina eucalypti on Eucalyptus regnans



Fig. 16: Cankers on twigs of Eucalyptus delegatensis caused by Mycosphaerella cryptica)

استفاده از آب گرم شده با مایکروویو

خودتان در مورد این عکس قضاوت کنید

پاسخ به سوال خاموشی ژنها در باکتری ها

فرایندی است که سلول باکتری را در مقابل ترنسپوزون ها و فاژ ها محافظت میکند ,به دو صورت Transcriptional gene silencing  و Post-transcriptional gene silencing  رخ ميدهد. كه ...

سال نو بر همه دوستان و همراهان دائمی وبلاگ مبارک باد

نظر نام مستعار: جویای علم

با سلام، من با نظر آقای یوسفی کاملا مخالفم، آخه بوعلی سینا بودن چه تناقضی با گرفتن جایزه نوبل داره؟ مگه دکنر حسابی که دانشمند بزرگ و بسیار قابل احترام کشور ماست بزرگترین و برترین جایزه علمی کشور فرانسه دریافت نکرد؟ مگه از حسابی بودنش کاسته شد و دیگه در راه خدمت به مردمش گام برنداشت و به پژوهشهای سازندش ادامه نداد؟ چرا باید الکی شعار داد؟ اصلا چرا شفافتر نمی گین تعریف شما از راه بوعلی چیه؟ به خدا اگه الان بوعلی زنده بود دهها جایزه نوبل به پاش میریختن اونوقت دیگه بوعلی نبود؟ مگه جایزه نوبل به غیر از کسانی میدن که در راه علم جانفشانی کردن؟ چرا سفسطه میکنین؟ گاهی زیاد بسط دادن مسائلباعث می شه انسان هدف اولیه یادش بره و از ادامه دادن راه بازبمونه، باید تلاش کرد تا نام ایران زنده کنیم، در هر سطح و مقطعی که هستیم چه در راه بوعلی دیروز چه در راه نوبل امروز.

نظر یعقوب احمد یوسفی

شما فکر می کنید اگر بوعلی الان زنده بود دنبال اخذ جایزه نوبل بود.
به یقین اگر چنین بود هرگز بوعلی نمی شد!

من نمی گویم که جایزه نوبل گرفتن کار خوبی نیست!
ولی برای بو علی شدن باید دنبال راه بوعلی بود نه جایزه نوبل

بقیه دوستان نظر بدن

نظر آقای مهندس میرزایی

بحث "تحقیقات کاربردی" باید در سرلوحه کار قرار گیرد.بحث آفتاب درمانی(Soil solarization) یکی از این مورداست. حتی تو اروپا با حداقل بهره از نور خورشید برخی بیمارگرهای خاکزاد تا 70% کنترل شده . تو کشور ما محدود به چند استان جنوبی و اصفهان است(اونهم برا کشت گلخانه). این رو باید به کشاورز تفهیم کرد که حتی برا کنترل علفهای هرز هم موثره و هزینه اون به اندازه روشهای روتین مبارزه با علفهای هرز میشه در حالیکه برا کنترل نماتدهای پارازیت گیاهی و قارچها موثره. در صورت آلودگی زیاد زمین میشه این روش رو با روش شیمیائی(واپام) تلفیق کرد. ولی اخیرا روش مذکور رو با تلفیق مالچ (مثلا کاه گندم) انجام میدن....

شناسايي عامل شانكر باكتريايي درختان گوجه سبز و آلوي وحشي در جنگلهاي استان گيلان

( مجله پژوهشي تحقيقات حمايت و حفاظت جنگل‌ها و مراتع ايران جلد 5 ، شماره 2 ، سال 1386 )
فهيمه جامي - گروه گياهپزشكي، دانشكده علوم كشاورزي دانشگاه گيلان، رشت مصطفي نيك نژاد كاظم پور - گروه گياهپزشكي، دانشكده علوم كشاورزي دانشگاه گيلان، رشت. سيدعلي الهي نيا - گروه گياهپزشكي، دانشكده علوم كشاورزي دانشگاه گيلان، رشت.
کليد واژه‌‌ها: شانكر باكتريايي، Pseudomonas syringae pv syringae، گوجه سبز وحشي، آلوي وحشي، گيلان.
	از اسفند ماه 1381 تا مهر ماه 1382 از درختان گوجه‌سبز و آلوي وحشي مشكوك به بيماري شانكر باكتريايي واقع در استان گيلان (تالش، هشتپر، ليسار، لاهيجان و آستانه) نمونه‌برداري بعمل آمد. مشخص‌ترين علائم بيماري، تشكيل شانكر به همراه تراوشهاي صمغي است. نواحي آلوده اندكي فرورفته و به رنگ قهوه‌اي تيره‌تري نسبت به پوست سالم مجاور بودند؛ رنگ بافتهاي پوست ناحيه شانكر بين نارنجي روشن تا قهوه‌اي متغير مي‌باشد. در برخي نواحي، تعداد زيادي از جوانه‌ها از بين مي‌روند. تحت شرايط جوي مناسب، آلودگي گلها نيز صورت مي‌گيرد و مي‌تواند بسيار شديد باشد. ممكن است آلودگي از گلها به شاخه منتشر شده و توليد بلايت شاخه نمايد و يا به داخل مهميز نفوذ كرده و باعث توليد شانكر شود. هنگامي كه ميوه آلوده شود، لكه‌هاي روي آن صاف، سطحي و به رنگ قهوه‌اي تيره در مي‌آيد. لكه‌ها 2-3 ميليمتر عمق داشته و فرورفته‌اند. نمونه‌برداري از سرشاخه‌هاي آلوده و شانكرهاي تنه صورت گرفت و عامل بيماري‌زا با كشت روي محيط‌‌كشتهاي باكتريايي مانند King's B و NA (آگار مغذي) جداسازي گرديد. در اين پژوهش تعداد 123 جدايه باكتري از درختان مشكوك به آلودگي جداسازي شد كه 28 جدايه در توتون و شمعداني فوق حساسيت ايجاد نمودند. تمامي آزمونهاي شناسايي بر روي اين 28 جدايه انجام پذيرفت. بر اساس خصوصيات فنوتيپي، تغذيه‌اي، مورفولوژيك (جدول 1) و نقوش الكتروفورزي پروتئينهاي سلولي، باكتري عامل شانكر درختان هسته‌دار تحت عنوان Pseudomonas syringae pv syringae شناسايي گرديد (Schaad, 2001). اثبات بيماري‌زايي جدايه‌ها روي برگ گوجه سبز (Yessad et al., 1992) و سرشاخه‌هاي جوان جدا شده (Jones, 1971) انجام شد. كليه جدايه‌ها پس از 5 روز لكه‌هاي آبسوخته و نقاط نكروز در ناحيه زخمها ايجاد نمودند (شکل 2). پس از تزريق هر يك از جدايه‌ها روي سرشاخه‌هاي آلو و گوجه‌سبز، ابتدا نقاط نكروز در محل تزريق مشاهده و پس از يك ماه اندام تلقيح شده كاملا نكروزه و خشك گرديد (شكل 3). در هر دو روش مايه‌زني (برگ و سرشاخه‌ها) نمونه شاهد با آب مقطر سترون تيمار شد كه هيچ‌گونه علائمي مشاهده نشد. آزمون توليد سيرينگومايسين نيز روي جدايه‌ها با استفاده از قارچ Geotrichum candidum صورت گرفت (Young et al., 1991). توليد سيرينگومايسين بوضوح در تمامي جدايه‌ها رديابي گرديد. 40 درصد از جدايه‌ها در هر دو تكرار توليد سيرينگومايسين داشته و از رشد قارچ جلوگيري نمودند. ميزان حساسيت جدايه‌ها به آنتی‌بيوتيک‌های مختلف با استفاده از روش Psallidas (Psallidas, 1993) انجام شد كه نتايج حاصل در جدول 2 آمده است. الكتروفورز پروتئين (PAGE–SDS) با استفاده از روش Laemmli با تغييرات اندكي انجام گرفت (Laemmli, 1970) و جدايه‌هاي مربوطه به همراه جدايه‌هاي استاندارد دريافتي از كشور فرانسه كلكسيون باكتريهاي بيماري‌زاي فرانسه (CFBP)[1] مورد مقايسه قرار گرفتند. كليه جدايه‌ها در الكتروفورز پروتئيني تام سلولي به روش PAGE-SDS يك‌بعدي در ژل پلي‌اكريل‌آميد 12% توليد نوارهايي نمودند. مقايسه نقوش پروتئيني جدايه‌ها وجود سطح بسيار بالايي از تشابه را در بين آنها و ايزوله استاندارد نشان مي‌داد و اختلافات جزئي در نوارهاي ايجاد شده توسط جدايه‌هاي فوق كه بيشتر به صورت قوي و ضعيف بودن و وجود يا عدم وجود يك يا چند باند بسيار ضعيف بود، ديده شد. با صرف نظر از اين اختلافات بسيار جزئي، مي‌توان اظهار نمود نقوش پروتئيني مربوط به جدايه‌ها با جدايه استاندارد تفاوتي با هم ندارند و داراي سطح بالايي از تشابه هستند (شكل4). اين اولين گزارش باكتري Pseudomons syringea pv syringea از درختان هسته دار جنگلي از استان گيلان مي‌باشد.

سلام به دوستان

خیلی وقتا فکر میکم که سمت و عنوان باعث دور شدن میشه تا نزدیک شدن

من و عزیزان زیادی تا حالا با هم همکلاس بودیم

و امیدوارم با دوستان زیادی همکلاس بشم

ولی این رفتن و اومدن ها این همکلاس شدن ها فقط این نیست که مدتی بگذره و یه نمرهای داده بشه و تموم و یا آخرش یه مدرکی کسب بشه

بلکه خیلی بالا تر از این حرف هاست

دوستان من همه این کارها برای پیشرفت و آبادانی مملکته

همش برای ایجاد رفاه بیشتر برای مردمه

برای ایجاد شادی بیشتر برای دیگرانه

برای خدمته به بندگانه خداست

دوستان بیایید و بجای اینکه اینقدر به فکر نمره باشیم به فکر مدرک باشیم

به خدا اول به خودم میگم

به فکر کمک به دیگران به فکر تلاش بیشتر برای انجام یه کار علمی که مشکل کسی رو حل کنه

مشکل مردم حل شه

خیرش به کسی برسه

باشیم

بیاید فکر کنیم چطور با کار علمی میتونیم باری رو از دوش کسی برداریم

دردی رو دوا کنیم

بییین بگردیم ببینیم مردم چه مشکلی در زمینه کشاورزی گیاهپزشکی در زمینه آلودگی محیط زندگی با سموم

در زمینه بیماری ها و افات مهم گیاهی دارند حل کنیم

بیااید  لبخند بر چهره غمگینی بگشاییم

از این پس هر کسی که با ارائه ایده ای جالب و مفید و قابل اجرا در فکر حل یکی از مشکلات کشور در زمینه رشته مرتبط با بنده باشه پس از معرفی در این وبلاگ و تایید سایر دوستان خواننده هدیه ای تقدیم میگردد. لازمه ابراز این ایده بررسی منابع معتبر میباشد.

در ضمن به خاطر ارج نهادن به تلاش دوستانی که از این پس با من درس میگذرانند به افراد با نمرات برتر که در طول ترم با ارائه سمینار در زمینه حل قابل اجرا برای  یکی از مشکلات کشور در آن زمینه درسی تحقیقی انجام دهند هدیه ای تقدیم میگردد.

  قصد دارم تا در اینده ای نزدیک با تاسیس صندوقی با عنوان صندوق تشویق ایده های مشکل گشا

بخصوص در زمینه گیاهپزشکی با تشویق دوستان مرتبط قدم کوچکی برای ایجاد انگیزه بیشتر در دوستان بردارم

از پروردگار تمنای یاری و نیت خالصانه و موفقیت در این مسیر را دارم.

بلند کردگارا علمی که سودش به بندگانت نرسد و لبخندی بر چهره کودکی نگشایدو درد دردمندی را رهایی نبخشد  بیفایده است.

ای بزرگ جان ما را به دانشی که در آن خیر و برکت برای بندگانت نهفته است زینت بخش ما را به عنوانی سربازی کوچک در اجرای دستوراتت بپذیر و ریا و دورنگی را از ما دور کن

خداوندا هیچ نیرویی به اندازه ذره ای در این عالم موثر نیست جز جان لایتناهی مقدست

 بار الاها علم را برای ما وسیله ای برای نزدیکی به خودت قرار ده و دانش را نوری کن که با آن حرکت کنیم  نه دستاویزی در دست شیطان که ما را از تو دور کند و نه مسیری برای فرو رفتن در تاریکی

خدایا به تو پناه میبرم از غفلتهای فراوان و از تکبر بسیار و از ضعف نفس و از دسیسه های شیطان

 خدایا بر علم ما بیافزا

توجه دوستان را به نظر خواننده محترم وبلاگ آقای میرزایی در مورد مطلب قبلی جلب میکنم

عامل این بیماری فیتوپلاسمائی هستش که محدود به آوند آبکشه. مبارزه با ناقل بعیده یک راه حل موثر برای مبارزه با بیماری باشد چون گسترش بیماری زیاد و بسیاری از لیموها و حتی بکرائی هم آلوده شده اند واز طرفی با نهال آلوده هم منتشر میشود. اگر اینطور باشد پس باید بیماری فیلودی خیار(که در محیط کنترل شده قرار دارد) ویا گل سبز کنجد هم قابل کنترل باشند. از طرفی بسیاری از گیاهان علفی از دیگر میزبانهای فیتوپلاسما به شمار میروند. با تشکر..........

این مطلب را گذاشتم روی قسمت های قرمز رنگ فکر کنید

کشف سم مقابله با بیماری جاروك لیموترش در ایران

به گزارش شبکه خبر به نقل از واحد مرکزی خبر، پژوهشگران کشورمان موفق شدند: پس از گذشت سه سال از اجرای برنامه جامع مدیریت بیماری جاروك لیموترش ، نخستین بار در جهان سم مقابله با آفت این محصول را کشف کنند. 

مدیر برنامه مدیریت جامع بیماری جاروك لیموترش با اشاره به اینكه برنامه جامع در سال 85 تدوین شد ، افزود: پژوهشگران با اجرای 45 طرح تحقیقاتی - با مشاركت حدود 30 مركز علمی دانشگاهی ، عامل بیماری ، ناقل ان و روش های مقابله با این آفت را شناسایی كردند. 

محسن مردی گفت : نخستین بار در جهان سم مهار و كنترل ناقل این بیماری شناسایی و در 60 هكتار به صورت آزمایشی استفاده شد كه پس از نهایی شدن نتایج در اختیار باغداران قرار خواهد گرفت. 

مدیر برنامه جامع مدیریت بیماری جاروك لیموترش افزود : پژوهشگران علاوه بر دستیابی به فرمول سم مقابله با بیماری ، به تركیبات شیمیایی و بیوشیمیایی جدیدی دست یافتند كه با تزریق به گیاه ازگسترش بیماری به بخش های دیگر درخت لیمو جلوگیری می كند. 

مردی گفت : نابودسازی و جایگزینی حدود سه هزارهكتاراز باغات بسیار الوده استان هرمزگان ، استقرار و توسعه دوازده پست قرنطینه در نوارهای مرزی استان های كرمان ، بوشهر و فارس از اقدامات برنامه مدیریت جامع بیماری جاروك لیموترش است. 

مدیر برنامه جامع مدیریت بیماری جاروك لیموترش افزود: بر اساس گزارش سیستم كنترل مدیریت كه روزانه روند پیشرفت برنامه را گزارش می دهد تاكنون از 53 درصد پیشرفت فزیكی كه در برنامه پیش بینی شده ، 45 درصد تحقق یافته است. 

مردی گفت:ردیابی بیماری در سه استان آلوده در 41 هزار هكتار از باغات لیموترش هم انجام شده است. 

لیموترش از محصولات باغی جنوب و جنوب شرقی ایران است و از 42 هزار هكتار کشت ان سالانه بیش از 600 هزار تن محصول تولید می شود. 

سهم ایران از تولید جهانی لیموترش حدود 40 درصد است و در تولید انواع لیموی ترش و شیرین درجایگاه ششم قرار دارد. 

سیستان و بلوچستان ، هرمزگان ، فارس ، منطقه جیرفت و كهنوج از مناطق اصلی كشت این محصول است و بیش از 40 هزار خانوار در ان اشتغال دارند. 

اما این باغات ارزشمند نزدیك به یك دهه است كه به بیماری مهلك جاروك لیمو ترش مبتلا شده است و شاهد نابودی تدریجی این باغ ها هستیم. 

این بیماری یك "شبه ویروس" است كه توسط پیوندك ها و حشرات ناقل الوده مانند زنجرك ها به درختان سالم منتقل می شود.
دوره كمون این بیماری از زمان ابتلا تا ظهور، شش تا چهارده ماه است و در4 تا 5 سال درخت لیمو را نابود می کند. 

این بیماری نخستین بار سال 1986 در عمان مشاهده شد و در بیست سال 95 درصد باغ های لیموترش این كشور را نابود كرد.
این بیماری نخستین بار دركشور ما سال 76 روی درختان لیمو ترش نیكشهر استان سیستان و بلوچستان و سپس در سال 77 در استان هرمزگان گزارش شد كه 51 اصله درخت باغات روستای كریان از توابع شهرستان این استان را الوده كرده بود.

مطلب آزاد

مدتی است که جنگ غزه فکرم را مشغول کرده است.به این می اندیشم که تا کی غرب با برتری علمی میباید بر دنیا حکومت کند ؟  این کشتار بیرحمانه و  این وحشیگری تحت حمایت غرب علیه هم کیشان ما و ادم های شرقی از جنس ما صورت میپذیرد

ای دوستان من.  وقت جهاد فرا رسیده است

بیایید دست به یک مبارزه بزرگ علمی بزنیم     ما میتوانیم به غربیان نشان دهیم

که علم از آن خداست و هر کسی با کوشش و تلاش میتواند برتری علمی بدست آورد و در راه خدا بکار گیرد نه در راه هوس بازی و جنایت و ستمگری

دوستان باید از همه لحظات در راه جهاد علمی استفاده کنیم

ما از نسل بزرگترین دانشمندان مانند بوعلی سینا هستیم

نگذاریم غربیها با برتری علمی ما را تحقیر کنند

نگذاریم اف ۱۶ به رخ ما بکشند

نگذاریم

 با تانک مرکابا و  جنگ افزار فسفری  موشک هدایت شونده   بمب خوشه ای

ما را تحقیر کنند

بیایید به جایی برسیم که در برابر علم و ایمان شرق زانو بزنند

ما میتوانیم

برای توانستن اول ایمانمان به ذات مقدس پروردگار را تقویت کنیم و با توکل به او تلاش کنیم

ای دوستان به شما میگویم که شرق پر از نابغه و ژن های هوشمند خاموش است بیایید ژن ها را روشن کنیم

ما میتوانیم   

  از کمبود امکانات. منابع و آدم های دلسوز خداجو  .              نترسید

نگویید دیگران چه میکنند  اگر دیگران تابع هوای نفس هستند شما نباشید

برای خدا قیام کنید حتی اگر یک نفرید

قُلْ إِنَّمَا أَعِظُكُم بِوَاحِدَةٍ أَن تَقُومُوا لِلَّهِ مَثْنَى وَفُرَادَى

تابع هوای نفس نباشید و برای پول و دنیا زندگی نکنید موحد باشید  زیرا

كَم مِّن فِئَةٍ قَلِيلَةٍ غَلَبَتْ فِئَةً كَثِيرَةً بِإِذْنِ اللّهِ

بییاید برای خدا تلاش کنیم که

جاء الحق و زهق الباطل ان الباطل کان زهوقا

 

جزوه درس اصول كنترل: از هر سم يك كاربرد حفظ شود(محدوده هر سم بارنگ قرمز و آبي مشخص )

---

 

ليست سموم رايج در ايران و مقدار مصرف آنها

 

نام عمومی قارچ کش	نام تجاری قارچ کش	فرمولاسیون	مقدار مصرف	موارد توصیه
ادیفنفوس	هینوزان	EC 50%	1لیتر	بلاست برنج
اكسي كلرور مس اکسی کلرورمس	کوپراویت	WP 35%	5-2درهزار                 1-2 Kg درهکتار	آتشک سیب و گلابی ü            لب شتری هلو ü            بلایت گردو ü            بیماری دارخور            غربالی هسته دارها          شانکر باکتریایی هسته دارها ü            لکه آجری بادام ü            آنتراکنوز گردو سفیدک دروغی سیب زمینی و گوجه فر سفیدک پودری گوجه فرنگی ü            ناتراسیا مرکبات(سرخشکیدگی)            گموز پسته    پوسیدگی گل آذین خرما  سفیدک داخلی جالیز وسبزی
ایپرودیون+کاربندازیم	رورال- تی اس	WP 52.5%	یک در هزار 1 کیلو گرم در هکتار دو در هزار	لکه قهوه ای نواری جــــــو            شیت بلایت ü            زردی نخود
ایمازالیل	فونگافلور	LS 5%	یک در هزار	لکه قهوه ای نواری جــــــــــو
بنومیل	بنلیت	WP 50%	نیم تا یک در هزار           1 Kg 1-1.5 Kg	لکه قهوه ای برنج            پوسیدگی ژیبرلای طوقه برنج           لکه سیاه سیب            سفیدک پودری سیب و هلو  شانکر سیتوسپورایی   پوسیدگی آرمیلاریایی ریشه       پوسیدگی سفید ریشه          زردی نخود      خشکیدگی سرشاخه توت    سفیدک سطحی چغندر قند لکه برگی سکوسپورایی چغندر
بیترتانول	بایکور	WP 25%	.75 در هزار	لکه سیاه سیب
پروپیکنازول	تیلت	EC 25%	0.5 – 1 لیتر در هکتار	سیاهک هندی             زنگهای غلات            فوزاریم ریشه و خوشه غلات ü        سپتوریوز گندم            شیت بلایت برنج           سیاهک آشکار نیشکر
پنکونازول	توپاز	EW 20%	0.125 درهزار	سفیدک حقیقی مــــــو
تبوکونازول	فولیکور	EW 25%	یک لیتر در هکتار	سیاهک هندی و زنگهای غلات
تبوکونازول	راکسیل	DS 2%	یک و نیم در هزار	سیاهک آشکار گندم و جـــــــو
تبوکونازول	راکسیل	FS 6%	نیم در هزار	سیاهک پنهان گنــــــــدم
تریادیمنول	بایتان	DS 7.5%	دو در هزار	سیاهک پنهان و آشکار گندم
تری تیکونازول	رئال	FS 20%	0.2 درهزار	سیاهک پنهان گنــدم
تری دیمورف	کالکسین	EC 75%	0.75 لیتر	سفیدک حقیقی چغندر قند
تری سیکلازول	بیم	WP 75%	نیم کیلوگرم	بلاست برنــــج
تیابندازول	تکتو	WP 60%	2 در هزار	مرگ گیاهچه سیب زمینی           سیاهک پاکوتاه گندم           مرگ گیاهچه حبوبات ü            برق زدگی نخود
تیابندازول+فلوتریافول	وینسیت پی	DS 5%	2 در هزار	سیاهک پنهان و آشکار گندم
تیوفانات متیل	توپسین ام	WP 70%	نیم در هزار	شانکر سیتوسپورایی   پوسیدگی آرمیلاریایی ریشه         پوسیدگی سفید ریشه
تیوفانات متیل تیرام	همای کت	WP 80%	3 در هزار	پوسیدگی طوقه و ریشه برنج (ژیبرلا)
دودین	ملپرکس	WP 65%	1در هزار	لکه سیاه سیــب
دیفنوکونازول	دیویدند	DS 3%	1-2 در هزار	سیاهک پنهان گندم         سیاهک پاکوتاه گندم
دیفنوکونازول	دیویدند	FS 3%	1 در هزار	سیاهک پنهان گندم
دینوکاپ	کاراتانLC	EC 35%	یک در هزار	سفیدک حقیقی هلو           سفیدک حقیقی سیب            سفیدک سطحی رز
دینوکاپ	کاراتانFN-57	Wp18.25%	یک الی دو در هزار	سفیدک حقیقی سیب           سفیدک حقیقی هلو           سفیدک حقیقی مـــو        سفیدک حقیقی جالیز       سفیدک سطحی یونجه         سفیدک پــــودری توتون        سفیدک پودری انبـــه      سفیدک سطحی چغندر        کنه حنایـی گوجه فرنگی
دینیکونازول	سومی ایت	WP 2%	دو در هزار	سیاهک پنهان و آشکار گندم
دینیکونازول	سومی ایت	FS 2%	یک در هزار	سیاهک پنهان گندم
زینب	دیتانZ-78	WP 80%	2 – 3 در هزار	آنتراکنوز گردو          لکه شکلاتی باقلا           سفیدک داخلی مــو          سفیدک دروغی چغندر           سفیدک دروغی توتون           کنه نقره ای مرکبات
سایپروکونازول	آلتو	SL 10%	0.5 – 1 لیتر در هکتار	ü            سیاهک هندی            زنگهای غلات           سپتوریوز گندم       سرکوسپورای برگ چغندر
سایپروکونازول+کاربندازیم	آلتوکمبی	SC 46%	0.6 لیتر	پوسیدگی فوزاریمی ریشه گندم            فوزاریم خوشه گندم
سولفور	گل گوگرد	پودر میکرونیزه	60 – 90 Kg	سفیدک پودری مــــو          انواع کنه های تارتن
سولفور	الوزان- کوزان	Wp 80-90%	1.5 -3در هزار	سفیدک حقیقی مـــــو         سفیدک حقیقی سیب          سفیدک پودری  جـــالیز         سفیدک سطحی یونجه       سفیدک سطحی رز        کنه اریوفید پستـــه   کنه های تارتن سبزی و جالیز
سولفور	الوزان- کوزان	DF 80%	3 در هزار	سفیدک حقیقی مـــــــو
سولفات مس+آب آهک	ترکیب بردو	---------	با نظر کارشناس 0.5 _10 درصد	آتشک درختان میوه دانه دار     فتیله نارنجی درختان میوه        پیچیدگی برگ هلو   بیماری غربالی هسته دارها    شانکر باکتریایی هسته دارها    شانکر باکتریایی مرکبات       لکه آجری بادام     پوسیدگی فیتوفتورایی درختان     آنتراکنوز گردو ü            گوموز مرکبات ü            انگومک پسته
فلوتریافول	ایمپکت	SC 12.5%	یک لیتر در هکتار	سیاهک هندی و زنگهای غلات
فلودیوکسونیل	سلست	FS 2.5%	دو در هزار	پوسیدگی طوقه و ریشه برنج (ژیبرلا)
کاپتان	اورتوساید- کاپتان	WP 50%	3 در هزار	لکه سیاه سیب    لب شتری هلو       غربالی درختان میوه      مومیایی درختان میوه       بوته میری نخود         لکه قهوه ای باقلا      لکه برگی آلترناریایی پسته      سفیدک داخلی چغندر قند
کاربندازیم	باویستین- دروزال	Wp 50-60%	دو در هزار	لکه برگی سرکوسپورائی چغندر قند    سیاهک آشکار جــو و گندم
کاربوکسین	ویتاواکس	Wp 75%	2 - 2.5 در هزار	سیاهک آشکار جــو و گندم   مرگ گیاهچه حبوبات     مرگ گیاهچه و بذر پنبه
کاربوکسین تیرام	ویتاواکس- تیرام	WP 75%	1-3 در هزار	پوسیدگی طوقه و ریشه برنج   مرگ گیاهچه چغندر قنـــــــد   سیاهک دروغـــــــــی برنج   بیماریهای بذر و گیاهچه پنبه  انواع سیاهکهای ذرت   لکه قهـــــــوه ای برگ ذرت  سیاهک پنهان و آشکار گندم    سیاهک آشکار و پنهان جــو   لکه قهوه ای نواری جــــــــو پوسیدگی فوزاریمی ریشه گندم   لکه قهــــــــوه ای برنج
کاربوکسین تیرام	ویتاواکسFF	FL 40 %	2.5 در هزار	سیاهک پنهان و آشکار گندم    سیاهک آشکار جــــــــــو
کلروتالونیل	داکونیل	WP 75%	1.5 Kg  در هکتار	آلترناریای گوجه فرنگی
مانب	دیتان M-22	WP 80%	1- 3 در هزار	سفیدک دروغی مـــــــــو      لکه شکلاتی باقلا    سفیدک سبزی و جالیز    لکه قهوه ای برگ یونجه     سفیدک داخلی چغندر قند   سفیدک دروغی توتون
مانکوزب	دیتان M-45	WP 80%	معمولاً محلول  1 -2 در هزار	آلترناریای گوجه و سیب زمینی سفیدک دروغی سیب زمینی و گوجه فرنگی   سفیدک داخلی یونجه     سیاهک سخت جــــو    مومیای میوه   لکه آجری بادام  برق زدگی نخود سفیدک داخلی و بوته میری جالیز  کنـــه زنگ مـــرکــبـات
متالاکسیل	ریدومیل	G 5 %	20 -25 Kg	سفیدک داخلی سبزی و جالیز     بوته میری سبزی و جالیز
نوآریمول	تریمیدال	EC 9 %	ü        0.75 در هزار ü        0.2 در هزار	سفیدک حقیقی سیب       سفیدک پودری مـــــو
هگزاکونازول	انویل	SC 5 %	0.25 در هزار	سفیدک حقیقی مــــو

 

خلاصه جزوه جلسه پایانی اصول کنترل بيماري ها برای بچه های غایب

۱- رقابت میان میکرو ارگانیسم ها در دو سطح ریزوسفر و فیلوسفر در کترل بیولوژیک مطرح میباشد.

۲- مکانیسم هایی که باکتری های آنتاگونیست در کنترل بیولوژیک از آن بهرمند هستند:

الف.مواد بازدارنده رشدی

ب.سیدروفور

ج.رقابت مکانی و کاهش مواد غذایی

د.مقاومت القایی

۳-خصوصیات یک عامل کنترل بیولوژیک مناسب:

الف.اختصاصی بودن بر ضد پاتوژن هدف

ب.قابل نجزیه بودن در محیط پس از استفاده

ج. هزینه اندک برای تکثیر انبوه

د.سرعت رشد و تکثیر زیاد

۴-آخرین طبقه بندی از باکتری های مفید و آنتاگونیست

الف. biocontrol-PGBB باکتری های افزایش دهنده رشدی آنتاگونیست

ب.PGPB:  تنها افزايش دهنده رشدي

۵-خصوصيات يك آنتاگونيست مناسب خاكزي:

الف-قدرت زندگي در محدوده دمايي بيشتر

ب-توانايي تكثير زياد در محيط مايع

ج-توانايي تشكيل اسپور هاي مقاوم

۶-  Azotobacter sp.: يك باكتري آزاد زي تثبيت كننده ازت ميباشد.

۷-

Azospirillum brasilense يك باكتري تثبيت كننده ازت ميباشد كه بيشتر در محيط ريزوسفر يلفت ميشود

۸- باكتري ريزوبيوم                                          

            ميزبان

 

Rhizobium  leguminosarum               Vicia (pea, vetch)

  Rhizobium trifolii                                Trifolium (clover)

Bradyrhizobium   japonicum                               Phaseolus (bean)

                                                                          Glycine (soybean)

                                                                           Parasponia

Sinorhizobium  meliloti                                 Medicago (alfalfa)

  

Azorhizobium                                      Sesbania (roots, stems)

(Azotobacter)

Mesorhizobium                                         Lotus

Frankia                                                Alnus (alder); various

الف.رابطه همزيستي در گونه هاي اين باكتري اختصاصي ميباشد.گونه ها و ميزبانها حفظ شود.

ب. ترشح موادي بنام فلونويد موجب جذب باكتري ميگردد. مثال:

 

luteolin : alfalfa : R. meliloti

 

naringenin & genestein : soybean

ج- ۱۲۰۰ گونه از خانواده لگومبنوز با اين باكتري ها رابطه همزيستي دارند

د.برخي از درختان جنگلي رابطه همزيستي با جنسFrankia دارند.

۹-

2-3-Dihydrixybenzoyl-glycine(2,3-DHBG)

سيدروفوري است كه توسط جنس باسيلوس ترشح ميگردد.

۱۰-

Agrobacterium radiobacter strain K84

اين آنتاگونيست همه اگروباكتريوم هايي كه توانايي استفاده از اوپين نوپالين را دارند از بين ميبرد يا كنترل ميكند.

نحوه استفاده آن بدين صورت است كه نهال را قبل از كاشت در خاك آلوده در محلول آن قرار ميدهند

 بر روي اكثر جدايه هاي اين باكتري بجز گونه A.vitis موثر ميباشد.

A radiobacter K1026

تفاوتش با ۸۴ در اين است كه ناحيه انتقال در پلازميد را كوچك كردند تا پلازميد به ساير باكتري ها منتقل نشود.

                                                            تقي نسب

سوره اعراف آیه58

زمین پاک نیکوُ  گیاهش به اذن خدا نیکو براید و زمین خشن بیرون نیاورد جز گیاه اندک و کم ثمر

ویژگی های باکتری های خاک:

                                                        مهران عزیز زاده‏ :خاکشناسی ۸۶

باکتری ها میکروب های بسیار کوچکی هستند که در خاک بسیار فراوان اند تنها در یک گرم از خاک بیلیون ها باکتری می تواند وجود داشته باشد .می توان تخمین زد که 60000 هزار نوع باکتری وجود دارد که بیش تر آنها نام گذاری شده اند و هر کدام نیز نقش های مربوط به خود را دارند بیشترشان در 10 سانتی متری از خاک یافت می شوند به دلیل اینکه در این ارتفاع خاک دارای مواد آلی است .
مشخصات باکتری ها
بعضی از باکتری ها خیلی ضعیف اند و با تغییر کم مقدرار خاک محیط اطرافشان می توانند کشته شوند بعضی دیگر از آنان بسیار قوی هستند یعنی می توانند دماهای خیلی بالا و خیلی پایین را تحمل کنند و از نوع دیگر این باکتریها می توانند تا آماده شدن محیط مناسب تا چندین دهه زنده بمانند و بعضی دیگر هم می توانند نیتروژن هوا را مستقیماً دریافت و آن را مورد استفاده گیاه قرار دهند و یا مواد را فاسد و خراب کنند جمعیت این میکروب ها در هوا و خاک مرطوب به شدت رشد می کند دما و خاک مناسب و  وجود کربن باعث تسریع این فرایند می شود بسیاری از میکروب ها با آزاد کردن
آنتی بیوتیک مانع رقیب مخصوص خود می شوند بنابراین بعضی باکتری ها می توانند مانع بعضی از بیماری ها شوند
که عاملشان میکروارگانیسم ها هستند .
انواع باکتری ها
دیکومپو سر :باکتری نقش بسیار مهمی در تجزیه مواد دارند به خصوص در ابتدای مراحل تجزیه و قتی که مقدار رطوبت زیاد است در مرحله بعدی از تجزیه میل به تسلط داشتن دارد . باسیل و پیسیدومونافلورسنس مثال هایی از باکتری های تجزیه کننده هستند بعلاوه این باکتری ها کود آلی یا گیاه خاک موجود در خاک را از بین نمی برند .
سازنده نیتروژن یا ایجاد کننده نیتروژن
باکتری رپزبیوم می تواند به دانه های سبزی آغشته شود و نیتروژن را در خاک ایجاد کند این باکتری سازنده ی نیتروژن در ریشه های سبزیجات مانند : شبدر، لوبیا و گیاهان دارویی و چیر و غیره زند گی می کنند این باکتری می تواند گاز نیتروژن موجود در هوا را دریافت کند وآنرا قابل استفاده برای گیاهان کند این فرم از دریافت نیتروژن می تواند هم ارز بابیش از صد کیلو گرم از نیتروژن در هر هکتار در طول یک سال باشد .
ازوتو باکتر ،ازوسپر یلیوم ، اگروباکتریوم ، گلولونوباکتر ، فلوافوباکتریوم و هیر باسپرلیوم از باکتری های تولید کننده ی نیتروژن هستند اغلب باکتری ها وابستگی گیاهی ندارند امروزه مخلوط کردن خاک با چنین ارگانیسمی یعنی افزایش بی قید و آزاد از نیتروژن به واسطه ی باکتری های مؤثری برای گیاه ندارد .
تعیین بیماری ها
باسیل میگاتریوم از باکتری هایی است که برای بیماری قارچی بنام ریزوهکتونیاسولینی مورد استفاده قرار می گیرد پسید و مونالی فلورسین برای نابودی این بیماری مؤثر است . باسیل سابتلیس برای از بین بردن بیماری پژمردگی جوانه ی کوچک گل آفتاب گردان که توسط باکتری هیلیانس به وجود آمده مؤثر می باشد تعدادی از باکتری ها برای جلوگیری از بیماری در جهان خرید و فروش می شود با این حال جلوگیری از اغلب بیماری های مخصوص خاص ، انواع خاصی از گیاهان است و شاید فقط شرایط محیط مؤثر باشد .
هوازی و غیر هوازی
باکتری های هوازی باکتری هایی هستند که به اکسیژن نیاز دارند بنابراین هر کجا که خاک مرطوب موجود باشد آنان میل به تکثیر دارند باکتری غیر هوازی که آنها نیاز به اکسیژن ندارند و اغلب آنان قدیمی ترین نوع باکتری ها را تشکیل می دهند که در خاک متراکم اند این نوع از باکتری ها علاقه به محیط های خیس خاک های خشک دارند و می توانند سم خود را تولید کنند که این سم رشد گیاه را محدود می کند و زمینه را برای بیماری ریشه مهیا می کند .
 
باکتری های پرتوی
این باکتری خاک ، کمک به پایین آوردن و تجزیه ی نمک آلی و اسید نمکی در خاک می کند باکتری های پرتوی pH بالاتر از 5 را ترجیح می دهند .
اکسید کننده ی سولفور
بسیاری از خاک شامل مواد معدنی سولفور است اما این فرم از سولفور در دسترس گیاهان نیست باکتری تیوباسل سولفور موجود در خاک را تبدیل به سولفات می کند تا در اختیار گیاه قرار گیرد .
مدیریت باکتری ها
اگرچه بیش تر پرورش ها آسان است ولی جمعیت باکتری ها نمی توانند در محیط خشک ، اسیدی ، شوری  و حجم فشرده (متراکم) بودن خاک زندگی و رشد کنند .
در این مورد تلقیح و کاشتن و ساختن محیط مناسب برای افزایش جممعیت باکتری ها فقط برای اضافه کردن آنها به خاک و کار بسیار مشکل و طاقت فرسایی است اگرچه جمعیت باکتری ها در خاک کم است شاید دلیل آن این است که محیط مناسب برای تکثیر و زندگی شان وجود ندارد .
 راهکار مؤثر در مدیریت باکتری ها (افزایش جمعیت آنان)
1.تصحیح کردن سلامت خاک از جمله اسیدی و فشرده بودن
1-تأمین زمین مناسب پوشیده شدن از علف یا ماده شیمیایی
هر کدام از این راهکارها فواید گوناگونی دارد و از افزایش جمعیت باکتری ها حمایت می کند .
 نکات کلیدیØ
1. تغییر جمعیت باکتری های خاک بستگی دارد به نم، رطوبت ، زمان در یک سال ، نوع پوشش گیاهی و ..
2. سلامت باکتری های خاک بستگی دارد به پوشش زمین که آنان را تشویق می کند .

زیست شناسی خاک مبانی اولیه خاک

                                                            حامد حسين پور

قارچ های خاک  برگرفته از النا انگام
زندگی قارچ های خاکی : قارچ ها سلول هایی هستند که معمولا به صورت رشته رشته های دراز در امتداد رودخانه یا کنار دریا رشد می کنند که به آنان هیفا می گویند و همچنین آنان بین خاکهای ریز ریشه ها و بین صحره ها زندگی می کند تنها درقطر یک دایره «اینچ» معمولاچندین هزار هیفا وجود دارد یک هیفا تنها می تواند پس از مدتی تکثیر شود که حتی طول آنها یک یا رد نیز برسد .
باکتری ترش کننده خمیر مثالی از یک باکتری تنها ست .
هیفا ها گاهی اوقات به صورت گروهی اند و به آنان مولد قارچ یا باکتری می گویند که ضخیم شبیه به ریسمان اند که به این نوع از باکتری یا قارچ ریز و مورف می گویند ریز و مورف ها غالبا شبیه به ریشه اند. ثمره قارچ ها «قارچ خوراکی» از هیفا کنار رودخانه وهاگ و موادی همانند آبجو که توسط هاگ پخش می شوند تشکیل شده است . شکل آنرا ببینید یک قارچ تنها می تواند بدنه سرتاسر میوه ها را که به بزرگی یک زمین بیسبال را فاسد کند.
قارچ ها نقش مهمی در حرکت آب – دوره گردش طبیعت و توقف بیماری دارند باکتری ها نقش بسزایی در تجزیه خاک و شبکه غذایی دارند آنان مواد غیر قابل تجزیه خاک را به مواد قابل استفاده تبدیل می کنند باکتری هیفا به تصفیه آب و نگهداری رطوبت خاک کمک می کند .
باکتری های خاک را می توان به 3 گروه تقسیم کرد . که چطور می توانند انرژی بگیرند.
1-قارچ ها تجزیه کننده : ساپروفیتک مواد اعضای مرده با کتری بیوماس را تبدیل به کربن دی اکسید و مولکول های کوچک مثل اسید ارگانیک تبدیل می کند این قارچ ها معمولا لایه پیچیده را مورد استفاده قرار می دهند . مانند سلولز و لیگنین در چوب در بعضی از آلودگی ها در تجزیه ساختار زنجیره ای کربن ضروریست .
نوع دیگر از قارچ ها بنام قارچ شکری وجود دارند که تعداد آنان اندک است . چون آنها لایه ها ساده را مانند باکتری های دیگر مورد استفاده قرار می دهند.
قارچ ها همانند باکتر یها نقش مهمی را در ثابت نگه داشتن مواد مغذی در خاک دارند.
بعلاوه بسیاری ازتحولات متابولیستی قارچ ها تولید اسید ارگانیک می کند بنابراین آنان به افزایش انباشتگی اسید نمکی غنی از ارگانیک کمک می کنند که در مدت هزاران سال پایداری خود را حفظ می کند.
قارچ های کورهیزال در ریشه گیاهان ساکن  می شوند. کربن را با گیاه معاوضه می کنند آنان کمک به تولید فسفر می کنند و مواد مغذی از جمله فسفر و نیتروژن و مقداری آب را درخاک بوجود می آورند دومین گروه از قارچ های کورهیزال، اندومای هیزال که در سلول ریشه رشد می کنند معمولا به گیاه وابسته اند یعنی به محصولات شاخه ای و سبزی ها و ثمره آن وابسته اند.
به طور مثال : ارباسکالر مای کور هیزال (AM) «بخش 4»
نوعی از قارچ بنام اندومایکورهیزال است .
سومین گروه باکتری ها انگل هستند که باعث کاهش تولیدات یا مرگ می شوند آنها در ریشه ها و دیگر اعضای گیاه نفوذ می کنند با کتری ها انگل ریشه عبارتند از ورتیکالیوم- پیتیوم و ریزوکتونیا که باعث کاهش تولیدات زراعی در هر سال می شوند بسیاری از قارچ ها کمک به بیماری  می کنند برای مثال باکتری کرم نیمودی که یک بیماری انگلی است باعث تولید کرم نیمادودی می شود.
شکل 1: بیشتر گیاهان به باکتری  جهت کشیدن مواد مغذی از خاک نیازمنداند ریشه درختان (قهوه ای) که به قارچ های «سفید روشن» وصل می شوند بیرون قارچ هیفا (سفید براق) نور به خاک منعکس می کنند.
برگرفته از رندنی مولینا
شکل 2قارچ ها شروع به تجزیه کردن برگ ورگه های علف می کنند برگرفته میکروبیولوژی خاک
شکل 3 باکتری اکتومای کورهیزال یکی از مهمترین باکتری هاست که در جذب مواد غذایی توسط ریشه ها موثر است .
قارچ در حقیقت تنها ریشه سلولی نیستند اما رخنه کردن به درون سلول گیاه و پوشاندن را به تنهایی انجام می دهند.
پوشش (روکش) در این عکس سفید است اما آنها شاید به رنگهای سیاه، نارنجی، صورتی و حتی زرد نیز باشند.
برگرفته از PNW
شکل 4 حجم  خطی تاریک در سلول های که روی ریشه پوشیده شده کیسه ای برای قارچ، اربالس کیولر است .
برگرفته از ان انگام
باکتر یها کجا هستند: باکتریهایی که دوستدار مواد گنیده اند معمولا در کنار گیاهان چوبی زندگی می کنند قارچ هیفا فواید بیشتری نسبت به باکرتیها در خاک دارد در وضعیت خشک قارچ ها می توانند رطوبت خود را حفظ کنند و ز نده بمانند و رشد کنند درحالی که اگر رطوبت خاک خیلی کم باشد بیشتر باکتری می توانند فعال باشند .
قارچ ها قاردند که نیتروژن را زا خاک جذب کنند وآنها را برای تجزیه سطح تفاله اغلب از نیتروژن کمی برخوردارند بکار ببرند قارچ ها از ارگانیسم هوازی برخورداند اگر خاک بی هوازی شود آنها برای یک دوره غیر فعال می شوند محیط بی  هوازی اغلب در خاکی که غیر قابل استفاده است در اثر چکیدن آب ، اتفاق می افتد.
قارچ معمولا در جنگل ها وسیع می شوند جنگل ها به افزایش تولیدات قارچ ها همانند بیوماس کمک زیادی می کنند.
در نواحی خشک مانند بیابان های شمال غربی قارچ های لوله ای برای مواد مغذی گیاه وجود دارند ..
برگرفته از بری باروو
شکل 6 قارچ های خوراکی معمولا درنواحی جنگل توسط قارچ های بنام بالید مایسید تولید می شوند قارچ های خوراکی که همانند تکه های یخ اند از شبکه پهناور هیفای زیر زمینی تولید شده اند برگرفته آنالیواند وسکی
قارچ های مای کوریزال در کشاورزی – مای کورهیزال نمادی از وابستگی میان قارچ و ریشه گیاه است و بی شباهت به تک تک آنان است . بیشتر در  ختان و بوته ها وثمره کشاورزی وابستگی ذاتی به مای کور هیزا دارند.
مقدار وابستگی به مایکورهیزا تنوع خوبی میان انواع محصولات ایجاد کرده از جمله گندم و ذرت
شکل 7 قارچ مای کورهیزال به ریشه های در خاک متصل می شوند د راین عکس ذرات شن ریشه های هیفا را محدود کرده اند
برگرفته از جر ی باروو