پزشکان گیاهان

Occurrence of Pseudomonas mediterranea on tomato in Brazil

plantago — Tue, 10 Nov 2009 11:27:55 GMT

L.M.R. Rodrigues¹, S.A.L. Destéfano², L.O.S. Beriam² and J. Rodrigues-Neto²*

¹Departamento de Proteção de Plantas, UNESP, 18.603-970, Botucatu, SãoPaulo, Brazil
²Laboratório do Bacteriologia Vegetal, Instituto Biológico, PO Box 70, 13.106-970, Campinas, São Paulo, Brazil

*julio@biologico.sp.gov.br

Accepted for publication 10 Sep 2009

During the years 2005-2008, symptoms of tomato pith necrosis (TPN) were observed that caused significant losses in several commercial cropsin the State of São Paulo, Brazil. Symptoms were similar to those reported for Pseudomonas corrugata or P. mediteranea and often first appeared near wounds where side-shoots had been removed, causing external dark brown necrosis of stems and degradation of pith (Fig. 1). Isolations from diseased plants on King’s medium B resulted in the growth of a bacterium with smooth or wrinkled colonies producing a greenish-yellow, non-fluorescent, diffusible pigment. Isolates were tested for pathogenicity on young tomato plants by placing a drop of bacterial suspension (10⁸cfu/ ml) in the leaf axils and then pricking the stem with a sterile needle. Control plants were similarly treated using sterile distilled water. Plants were maintained in a glasshouse with temperatures ranging from 25 to 30º C. The type strains of Pseudomonas corrugata (IBSBF 647^T) and P. mediterranea (IBSBF 2059^T) were used for comparative purposes.

The pathogenicity of isolateswas confirmed two weeks after inoculation (Fig. 2). The bacteria were aerobic, positive for oxidase, arginine dihydrolase, nitrate reduction to nitrites, meso-tartrate and histamine utilization, and negative for levan production and aesculin hydrolysis. In rep-PCR using BOX primers, the isolates showed identical profiles to those of the type strain of P. mediterranea (Fig. 3). In PCR using the primers type I ( PC5/1 and PC5/2) for P. corrugata and type II (PC1/1 and PC1/2) for P. mediterranea (Catara et al., 2002) the identities of strains were confirmed by the amplification of a 600 bp DNA fragment specific to P. mediterranea (Fig. 4). Until now, only P. corrugata had been reported as causing TPN in Brazil (Martins et al., 1990; Rodrigues-Neto et al., 1990). Consequently, this is the first report of P. mediterranea causing TPN in Brazil.

Figure 1: External symptoms of pith necrosis caused by Pseudomonas mediterranea on tomato stem

Figure 2: Pith discoloration in a tomato stem after artificial inoculation with a Brazilian isolate of Pseudomonas mediterranea

Figure 3: BOX-PCR fingerprinting patterns of Pseudomonas corrugata and Pseudomonas mediterranea; (M) 100 bp DNA marker, (1) Pseudomonas corrugata type strain (IBSBF 647T) , (2) Pseudomonas mediterranea type strain (IBSBF 2059T), (3-6) Pseudomonas mediterranea isolates from Brazil (IBSBF 1903, IBSBF 2642, IBSBF 2643, IBSBF 2652)

Figure 4: PCR amplification of 1100 bp and 600 bp DNA fragment of (1) Pseudomonas corrugata type strain (IBSBF 647T) , (2) Pseudomonas mediterranea type strain (IBSBF 2059T), (3-7) Pseudomonas mediterranea isolates from Brazil (IBSBF 1903, IBSBF 2642, IBSBF 2643, IBSBF 2652, IBSBF 2654), (M) 100 bp DNA marker

References

Catara V, Sutra L, Morineau A, Achouak W, Christen R, Gardan L, 2002. Phenotypic and genomic evidence for the revision of Pseudomonas corrugata and proposal of Pseudomonas mediterranea sp. nov. International Journal ofSystematic andEvolutionary Microbiology 52, 1749-1758.

Martins OM, Couto ME, Patella AEC, 1990. Occurrence of Pseudomonas corrugata on tomato in Rio Grande do Sul, Brazil. (Abstract from Congress of the Brazilian Phytopathololgical Society.) Fitopatologia Brasileira 15, 125.

Rodrigues-Neto J, Malavolta Jr VA, Ramos RS, Sinigaglia C, 1990. Ocorrência de Pseudomonas corrugata em tomateiro no Estado de São Paulo. Summa Phytopathologica 16, 279-284.

Acidovorax avenae subsp. citrulli newly reported to cause bacterial fruit blotch of watermelon in Gr

plantago — Tue, 10 Nov 2009 11:23:13 GMT

M.C. Holeva*, C.D. Karafla, P.E. Glynos and A.S. Alivizatos

Benaki Phytopathological Institute, 8 S. Delta Str. GR-145 61 Kifissia, Attiki, Greece

*m.holeva@bpi.gr

Accepted for publication 06 Oct 2009

In July 2005 and September 2006, samples of mature fruits of F1 hybrid watermelon (Citrullus lanatus) cv. Obla were received from the areas of Chryssoupoli (Macedonia, northern Greece) and Vagia (central Greece), respectively. Fruits had small, irregular, water-soaked lesions and brown cracks on their surface, brown discolouration and water-soaked areas in the rind underneath the lesions, and watery flesh rot (Figs. 1, 2). Disease incidence was reported as severe in both areas, according to the sample information sheets sent by local agronomists. Bacterial isolates recovered on nutrient agar (NA) from the affected fruits were Gram-negative, oxidase positive, non-fluorescent on King’s medium B, pathogenic to inoculated watermelon fruits and to seedlings of watermelon, melon, cucumber and pumpkin; isolates induced tobacco hypersensitivity and formed characteristic white colonies on nutrient agar. Based on these data, the isolates were identified as Acidovorax avenae subsp. citrulli (Aac).

In May 2008, young grafted watermelon plants (F1 hybrid cv. Byblos) received from the area of Varda (Peloponnese, southern Greece) showed brown, angular, necrotic spots or larger lesions on leaves (Figs. 3, 4). This outbreak was reported by the agronomist in charge of the crop to have affected about 50% of a plot of 12,000 plants. The bacterial isolates recovered on NA from the affected plants showed the above properties and also growth at 41°C, no starch hydrolysis, oxidative glucose metabolism and utilisation of D-galactose, D-glucose, L-arabinose, but not adonitol, arginine or sucrose, as sole carbon source. An immunofluorescence test with Aac-specific polyclonal antiserum (LOEWE, Germany) and sequencing (COGENICS, UK)of the products of PCR with two sets of Aac-specific primers, viz. BX-L1F/BX-R5F and BX-L1F/BX-S-R2R (Bahar et al., 2008), or the set 63f/1389r (Osborn et al., 2000) amplifying part of the 16S rDNA region, verified the isolates as Aac.In Rep-, Eric- or Box-PCR, the isolates from plants and Aac reference strains produced similar banding patterns. Koch’s postulates were fulfilled on seedlings and fruits of the above mentioned cucurbits with all isolates from plants. One such isolate was deposited in the Benaki Phytopathological Institute Culture Collection as BPIC2124. This is the first report confirming Aac naturally infecting watermelon plants and fruits in Greece.

Figure 1: Watermelon fruit naturally infected by Acidovorax avenae subsp. citrulli, showing irregular, water-soaked lesions and brown cracks on the surface

Figure 2: Section of watermelon fruit naturally infected by Acidovorax avenae subsp. citrulli, showing water-soaked areas in the rind underneath the surface lesions and watery rot of the flesh.

Figure 3: Young grafted watermelon plant naturally infected by Acidovorax avenae subsp. citrulli

Figure 4: Leaf of a young grafted watermelon plant naturally infected by Acidovorax avenae subsp. citrulli, showing symptoms of brown, angular, necrotic spots and larger necrotic areas

Acknowledgements

The authors wish to thank Dr S. Burdman for providing the Aac reference strains: W1, M1 (Bahar et al., 2008).

References

Bahar O, Efrat M, Hadar E, Dutta B, Walcott RR, Burdman S, 2008. New subspecies-specific polymerase chain reaction-based assay for the detection of Acidovorax avenae subsp. citrulli. Plant Pathology 57, 754-763.

Osborn AM, Moore ERB, Timmis KN, 2000. An evaluation of terminal-restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analysis for the study of microbial community structure and dynamics. Environmental Microbiology 2, 39-50

طبقه بندی باکتری های گیاهی Proteobacteria

plantago — Sat, 31 Oct 2009 15:11:18 GMT

Phylum "Proteobacteria"

Class Alphaproteobacteria"
Order Rhizobiales

Family Beijerinckiaceae
Beijerinckia - Chelatococcus - Methylocapsa - Methylocella - Methylovirgula

Family Bradyrhizobiaceae
Afipia - Agromonas - Balneimonas - Blastobacter - Bosea - Bradyrhizobium - Nitrobacter - Oligotropha - Rhodoblastus - Rhodopseudomonas

Family Rhizobiaceae
Agrobacterium - Allorhizobium - Carbophilus - Chelatobacter - Ensifer - Kaistia - Rhizobium - Sinorhizobium

Family Xanthobacteraceae
Ancylobacter - Azorhizobium - Labrys - Pseudolabrys - Pseudoxanthobacter - Starkeya - Xanthobacter

Unclassified Rhizobiales
Amorphus

Order Rhodobacterales

Order Rhodospirillales

Order Rickettsiales

Order Sneathiellales

Family Sphingomonadaceae
Blastomonas - Erythromonas - Novosphingobium - Rhizomonas (rejected name) - Sandaracinobacter - Sandarakinorhabdus - Sphingobium - Sphingomonas - Sphingopyxis - Sphingosinicella - Zymomonas

Class Betaproteobacteria

Order Burkholderiales

Family Alcaligenaceae
Achromobacter - Advenella - Alcaligenes - Azohydromonas - Bordetella - Brackiella - Castellaniella - Derxia - Kerstersia - Oligella - Parasutterella - Pelistega - Pigmentiphaga - Pusillimonas - Sutterella - Taylorella - Tetrathiobacter

Family Burkholderiaceae
Burkholderia - Chitinimonas - Cupriavidus - Lautropia - Limnobacter - Pandoraea - Paucimonas - Polynucleobacter - Ralstonia - Thermothrix - Wautersia

Family Comamonadaceae
Acidovorax - Alicycliphilus - Brachymonas - Caenimonas - Caenibacterium - Caldimonas - Comamonas - Curvibacter - Delftia - Diaphorobacter - Giesbergeria - Hydrogenophaga - Hylemonella - Lampropedia - Macromonas - Malikia - Ottowia - Pelomonas - Polaromonas - Pseudacidovorax - Ramlibacter - Rhodoferax - Roseateles - Schlegelella - Simplicispira - Tepidicella - Variovorax - Verminephrobacter - Xenophilus -

Unclassified Burkholderiales - - Rhizobacter - - Xylophilus

Order Nitrosomonadales

Gallionella

Family Nitrosomonadaceae
Nitrosolobus - Nitrosomonas - Nitrosospira

قارچ خوراكي و ميكوريز Cantharellus cibarius با نام محلي زرد كيجا از جنگلهاي ايران

plantago — Sun, 11 Oct 2009 02:11:36 GMT

نام زرد كيجا يك نام مازندراني براي اين قارچ است كه كيجا به معناي دختر (ريكا به معناي پسر) و زرد نيز بخاطر رنگ قارچ مي باشد. نام انگليسي اين گونه Cantherelle و The girolle مي باشد و از گروه قارچهاي Chanterelles بوده و از خانواده Cantharellaceae مي باشد.

اعترافات شب قدر

plantago — Tue, 08 Sep 2009 20:54:18 GMT

سلام

اول این و بگم که من تو ماه رمضون هر شبم شبه قدره جون هر شب تا سحر بیدارم

گاهی بر میگردم و به عدم موفقیت هام نگاه میکنم

فقط یه دلیل توش میبینم و اون شرک به خداست

دوستان و عزیزان

یه موقعی یه امتحان مهم داشتم

اون امتحانی بود که صد شرکت کننده داشت و دو سه برنده

یکی از برگزارکنندگان اون امتحان از دوستان من بود

من بسیار علاقمند بودم تا تو اون امتحان قبول بشم

مدت زیادی هم مطالعه کرده بودم

پس از برگزاری امحان با اینکه امتحانم خیلی خوب بود اما شیطان وسوسه ام کرد

من رو مقداری از مسیر اعتماد و توکل به خدای آفریدگار دور کرد و یه تماسی با دوستم گرفتم و ازش خواستم که هوای من رو داشته باشه

ای وای بر این نفس

آیا خداوند برای موفقیت کافی نبود

آیا جز اراده خداوند هیچ اراده دیگری بر سرنوشت ما موثر است

آیا هیچ خیر خواهی خیر خواه تر از خدا وجود دارد

بعد از این که در کمال ناباوری قبول نشدم به یاد داستانی افتادم که خداوند نقل کرد

زمانی که یوسف در زندان لحظه ای از یاد خدا غافل شد و از اون زندانی که در حال ازاد شدن بود خواست که در نزد شاه برای او وساطت کند تا آزاد شود اما نه تنها آزاد نشد بلکه چندین سال دیگر نیز تنبیه شد

ای پروردگار مهربان

از گناه من در گذر که به اشتباه خود پی بردم ودر نزد تو و در نزد بندگانت جهت هوشیار باش ایشان معترفم

خداوندا هیج موثری در عالم غیر تو موجود نیست

به تو ایمان داریم و به تو توکل میکنیم

شیطان را دشمن میداریم که او بزرگترین دشمن ماست

یا رب درگذر

خدا بزرگترین است

حفظ آبروی مومن و مسلمان

plantago — Tue, 08 Sep 2009 00:07:02 GMT

دوستان

یکی از بزرگترین گناهان در نزد پروردگار بردن آبروی مومن است

بسیار هوشیار باشید آبروی مومنین را حفظ کنید تا خداوند آبروی شما را حفظ کند

روزی به جمع پیامبر بزرگ منش(سلام خدا بر او) و نزدیکان خبر آوردند که در فلان جا دو نفر مشغول زنا هستند

پیامبر در میان یاران رو به امام گرانسنگ علی( درود خدا بر او) نمود و ایشان را برای رسیدگی مامور کردند

ایشان پس از بازگشت گفتند من زمانی که چشم گشودم کسی را ندیدم

خبر رسان قسم یاد کرد که مطمئن است که دو نفر آنجا مشغول زنا بودند

پیامبر مجدد از علی جویا شد. ایشان گفت من در را باز کردم در حالی که چشمانم بسته بود و زمانی که چشم گشودم کسی را آنجا ندیدم.

پیامبر فرمود به همین جهت تو را فرستادم.

عزیزان این رسم و منش بزرگان است: حفظ آبرو

اگر ذره ای از روز جزا واهمه دارید حفظ آبروی مومنین کنید پرده دری نکنید

فکر نکنید که با کوچک کردن دیگران بزرگ میشوید

و بدانید که بزرگی از آن خداست و تنها به اهل تقوی عنایت میگردد

خداوند مدافع مومنین است

در جایی خواندم

در لحظه ای که مومنی لغزش کند و مشغول گناهی گردد خداوند به فرشتگان دستور میدهد که بالهای خود را باز کنید تا عالم بالا گناه بنده ام را نبینند

بندگان خدا

آنکه سرور و مولای ماست اهل عفو و بخشایش است

ای انسانها چرا از بردن آبروی دیگران نمیترسید

بدتر از آن اینکهُ مومنی پاکمنش را با تهمت بی آبرو کنیم آن هم در جهت منافع مادی و دنیوی

کسب جاه و مقام دنیوی فراموشی خدا

پناه بر خدا ُ پناه بر خداُ ُ پناه بر خدا

خدایا تو بزرگترینی رحم کن بر این بنده کوچکترین

نکات اخلاقی

plantago — Sun, 06 Sep 2009 23:55:18 GMT

سلام

به دوستان و خوانندگان عزیز وبلاگ

از این پس قصد دارم علاوه بر مطالب علمی برخی مسائل اخلاقی را هم در وبلاگم بگنجانم

امیدوارم پروردگار راضی باشد و از تقصیرات و کوتاهی های ما در گذرد

اول اینکه بنده خدا باشیم این جمله کوتاه بسیار پر معنی و عمیق است

یکی از معانی بسیار نزدیک آن این است که بنده نفس خود نباشیم و بنده انسان های دیگر نباشیم

عزیزان بنده خدا باشیم فقط بنده خدا غیر از خدا هیچ کس شایسته اطاعت نیست

حتی در مورد پدر و مادر که بسیار توصیه شده است به نیکی و احسان به آنها پروردگار میفرماید در مواردی که شما را به امری خلاف دستورات الهی فرمان میدهند اطاعت نکنید

دوستان: بنده خدا باشید او به شما روزی میدهد و بخاطر پول و مقام دنیا بندگی بندگان ناصالح نکنید

بخاطر پول و مقام نافرمانی خدا نکنیم رضای خدا بسیار بالاتر از رضایت مقامداران و ثروتمندان اهل هوای نفس میباشد

خدا بزرگترین است

ادامه دارد...

سایت بسیار جالب در مورد تریکودرما

plantago — Wed, 26 Aug 2009 09:18:43 GMT

ادرس سایت

گونه های تریکودرما

plantago — Wed, 26 Aug 2009 09:14:16 GMT

Hypocrea andinensis - Hypocrea ceramica - Hypocrea cremea - Hypocrea cuneispora - Hypocrea estonica - Hypocrea neorufa - Hypocrea nigrovirens - Hypocrea patella - Hypocrea semiorbis - Hypocrea stilbohypoxyli - Hypocrea surrotunda - Trichoderma aggressivum - Trichoderma arundinaceum - Trichoderma asperellum - Trichoderma atroviride - Trichoderma aureoviride - Trichoderma brevicompactum - Trichoderma citrinoviride - Trichoderma crassum - Trichoderma erinaceum - Trichoderma fasciculatum - Trichoderma fertile - Trichoderma gamsii - Trichoderma ghanense - Trichoderma hamatum - Trichoderma harzianum - Trichoderma koningii - Trichoderma koningiopsis - Trichoderma longibrachiatum - Trichoderma minutisporum - Trichoderma oblongisporum - Trichoderma ovalisporum - Trichoderma polysporum - Trichoderma pseudokoningii - Trichoderma pubescens - Trichoderma reesei - Trichoderma saturnisporum - Trichoderma spirale - Trichoderma strictipile - Trichoderma strigosum - Trichoderma stromaticum - Trichoderma tomentosum - Trichoderma virens - Trichoderma viride - Trichoderma viridescens

نارون

plantago — Tue, 11 Aug 2009 07:02:18 GMT

درخت نارون ( لی ؛ اوجا ) از وبلاگ گیلانیکا

نارون با نام علمی Ulmus minor و در زبان گیلکی آن را " لی " و مازندرانی ها آن را " اوجا " می نامند.

نارون, درخت یا درختچه ای است که پوست آن در وهله ی اول صاف است.

و پس از مدتی, پوست درخت رگه رگه می شود ( رگه طولی ).

شاخه های آن پوشیده از برگ های متناوب بیضی و دارای دمبرگ است. پهنک برگ آن قرینه نیست و دندانه های زیادی دارد.

دسته های گل آن قبل از روییدن برگ ها, روی شاخه های کوتاه می شکفد. عمل گرده افشانی این گیاه به کمک باد انجام می شود.

میوه ی آن پس از خشک شدن به سرعت از غلاف خود بیرون نمی آید.

این گیاه در حاشیه بیشه زارها و جنگل های مخلوط و مرطوب در ارتفاعات پایین می روید. نارون را غالباً در پارک ها و باغ ها می کارند.

پوست این گیاه از نظر پزشکی دارای ارزش است. نخست, شاخه های جوان را برش طولی داده, سپس آن ها را با دست جدا می کنند ( قطر شاخه حدود یک سانتیمتر).